128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0738 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  100 
 
 		 166 aa  347  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  60.8 
 
 		 176 aa  213  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  61.31 
 
 		 168 aa  207  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  60.12 
 
 		 168 aa  204  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  56.02 
 
 		 163 aa  191  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  56.02 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  53.89 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  51.85 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  48.47 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  49.7 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  47.06 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  46.67 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  44.91 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  42.94 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  44.64 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  38.92 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  46.06 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  41.1 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  41.57 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  42.77 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  44.85 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  39.76 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  49.08 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  49.08 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  40.36 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  39.88 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  40.83 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  39.16 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  39.76 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  39.76 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  39.76 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  39.76 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  39.88 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  38.55 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  45.62 
 
 		 180 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  38.55 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  45 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  37.95 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  39.02 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  39.02 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  46.34 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  37.35 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  42.21 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  43.4 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  35.76 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  40.36 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  36.14 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  42.68 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  45.59 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  42.14 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  40.88 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  35.98 
 
 		 575 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  42.86 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  41.5 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  45.65 
 
 		 286 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  43.12 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  45.65 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  42.24 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  43.21 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  41.67 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  43.97 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  33.54 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  36.59 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  39.6 
 
 		 148 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0027  cupin superfamily protein  33.75 
 
 		 203 aa  97.4  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  38.36 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  94.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  38.3 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  38 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  40.56 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  38.79 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  39.29 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  39.31 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  39.73 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  38.73 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  39.57 
 
 		 146 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  37.06 
 
 		 148 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  38.85 
 
 		 148 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  36.69 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  87.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  35.19 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  40.71 
 
 		 154 aa  87.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  37.41 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  38.78 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  39.16 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  35.25 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  39.42 
 
 		 135 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  36.02 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  38.97 
 
 		 133 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  38.36 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  37.14 
 
 		 140 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>