128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3029 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  80.13 
 
 		 161 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  76.92 
 
 		 160 aa  262  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  77.56 
 
 		 160 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  77.56 
 
 		 160 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  78.21 
 
 		 162 aa  262  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  76.92 
 
 		 159 aa  260  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  76.92 
 
 		 160 aa  259  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  77.56 
 
 		 156 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  77.56 
 
 		 160 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  76.92 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  76.92 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  76.92 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  59.88 
 
 		 164 aa  204  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  58.54 
 
 		 167 aa  201  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  58.64 
 
 		 164 aa  200  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  46.45 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  47.24 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  44.91 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  46.3 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  42.77 
 
 		 166 aa  144  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  45.73 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  46.2 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  42.05 
 
 		 176 aa  140  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  45.06 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  41.57 
 
 		 166 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  44.87 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  42.77 
 
 		 164 aa  133  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  40.36 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  44.65 
 
 		 170 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  37.58 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  37.58 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  38.69 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  42.6 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  39.76 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  39.52 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  43.11 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  40.91 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  39.38 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  37.09 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  39.13 
 
 		 180 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  39.75 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  43.48 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  38.51 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  44.44 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  35.48 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  45.04 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  46.97 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  38.32 
 
 		 164 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  44.03 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  46.97 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  42.75 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  43.88 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  37.95 
 
 		 575 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  42.11 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  41.79 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  41.98 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  44.27 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  42.11 
 
 		 194 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  40.14 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  41.22 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  36.31 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  44.7 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  45.04 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  44.27 
 
 		 136 aa  104  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  42.75 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  40.46 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  38.99 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  36.81 
 
 		 193 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  37.11 
 
 		 172 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  36.88 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  37.11 
 
 		 172 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  40.71 
 
 		 271 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  42.11 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  38.81 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  37.33 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  36.25 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  38.12 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  36.25 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  38.12 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  39.69 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  37.78 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1550  hypothetical protein  34.62 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  43.7 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  40.43 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  41.1 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  38.93 
 
 		 140 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  42.86 
 
 		 133 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2150  hypothetical protein  35.95 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  36.25 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  37.96 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  38.85 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  38.93 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  34.72 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  37.5 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  36.36 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>