128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4717 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  61.85 
 
 		 180 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  63.1 
 
 		 172 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  63.1 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  63.1 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  62.64 
 
 		 172 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  63.19 
 
 		 170 aa  198  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  59.65 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  68.89 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  68.89 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  69.63 
 
 		 168 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  68.15 
 
 		 168 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  68.89 
 
 		 168 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  66.67 
 
 		 168 aa  181  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  67.41 
 
 		 168 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  52.47 
 
 		 171 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  50.3 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  49.69 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  49.39 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  50.63 
 
 		 157 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  48.55 
 
 		 173 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  52.15 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  46.11 
 
 		 168 aa  141  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  45.78 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  45.34 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  36.14 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  45.45 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  41.25 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  41.25 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  38.04 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  44.58 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  45.09 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  46.34 
 
 		 166 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  45.73 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  39.24 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  34.55 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  49.64 
 
 		 144 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  48.59 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  48.59 
 
 		 146 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  48.59 
 
 		 146 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  39.49 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  39.13 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  34.36 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  39.39 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  47.33 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  48.2 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  53.28 
 
 		 135 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  38.04 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  38.51 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  38.51 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  46.72 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  38.51 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  49.29 
 
 		 154 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  41.67 
 
 		 164 aa  114  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  47.14 
 
 		 140 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  48.55 
 
 		 145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  48.57 
 
 		 142 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  41.18 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  42.42 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  47.18 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  47.83 
 
 		 144 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  35.98 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  36.65 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  37.27 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  37.27 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  45.39 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  37.27 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  37.27 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  46.43 
 
 		 140 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  40.46 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  46.72 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  47.41 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  40.12 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0305  hypothetical protein  46.38 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.275629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  36.81 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  45 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  35.91 
 
 		 575 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  46.72 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  45.07 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  41.57 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0027  cupin superfamily protein  31.69 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  44.93 
 
 		 154 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  37.86 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  45 
 
 		 147 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  33.92 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  47.14 
 
 		 145 aa  101  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  41.26 
 
 		 170 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03971  hypothetical protein  36.24 
 
 		 155 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.283111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0862  protein of unknown function DUF985  43.57 
 
 		 148 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0577579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  42.31 
 
 		 155 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03981  hypothetical protein  36.24 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  38.03 
 
 		 174 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1501  hypothetical protein  42.75 
 
 		 133 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0425367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  45.39 
 
 		 140 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2039  hypothetical protein  43.57 
 
 		 152 aa  95.1  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0364  hypothetical protein  36.49 
 
 		 155 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  45.39 
 
 		 140 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>