128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2553 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  65.94 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  66.17 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  63.77 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  64.49 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  59.71 
 
 		 155 aa  167  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  61.97 
 
 		 147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  58.62 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  60.28 
 
 		 142 aa  156  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  58.33 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  59.29 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  58.27 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  56.93 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  62.41 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.671361 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  55.56 
 
 		 170 aa  150  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  56.94 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  56.94 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  56.74 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  57.34 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  55.94 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  57.14 
 
 		 146 aa  146  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  56.74 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  56.64 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  59.85 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  58.65 
 
 		 136 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  63.21 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  55.15 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  48.39 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  52.86 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  54.01 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  48.18 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  38.96 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  48.32 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  46.98 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  46.62 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  45.89 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  43.33 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03971  hypothetical protein  42.11 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.283111  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  48.3 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  44.59 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0364  hypothetical protein  41.35 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  46.53 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03981  hypothetical protein  40.6 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  47.45 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0305  hypothetical protein  47.76 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.275629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  45.99 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  41.3 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  39.47 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  42.67 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  45.8 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  42.36 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  46.43 
 
 		 168 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  42.75 
 
 		 271 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  47.86 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  47.86 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  44.37 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  44.93 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  46.38 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  39.57 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  46.43 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  46.43 
 
 		 168 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  48.18 
 
 		 286 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  43.17 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  45.93 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  45.59 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  45.59 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  45.59 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  34.01 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  43.97 
 
 		 180 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  44.06 
 
 		 168 aa  98.2  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  41.38 
 
 		 170 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  40.85 
 
 		 191 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  44.44 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  34.69 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  44.29 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2150  hypothetical protein  43.33 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  39.42 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  39.84 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  39.84 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  35.92 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  45.71 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  45 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  43.26 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  38.69 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  41.13 
 
 		 195 aa  95.5  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  42.75 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  37.68 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  37.96 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  42.96 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  38.69 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  39.31 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  43.57 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  39.85 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  37.96 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  43.28 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  39.85 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  39.85 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  39.85 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  40.56 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>