128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3937 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  100 
 
 
168 aa  349  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  67.48 
 
 
164 aa  230  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  60.98 
 
 
171 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  50.6 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  54.22 
 
 
166 aa  181  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  57.32 
 
 
195 aa  180  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  57.06 
 
 
170 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  47.31 
 
 
191 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  43.98 
 
 
166 aa  174  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  55.49 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  40.96 
 
 
166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  49.4 
 
 
173 aa  160  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  50.3 
 
 
157 aa  157  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  49.69 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  54.09 
 
 
168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  50.31 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  44.58 
 
 
167 aa  151  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  53.46 
 
 
168 aa  150  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  50.31 
 
 
170 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  54.09 
 
 
168 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  50.3 
 
 
193 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  50.92 
 
 
168 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  50.92 
 
 
168 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  47.37 
 
 
171 aa  147  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  47.62 
 
 
164 aa  147  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  50.31 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  50.31 
 
 
168 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  48.17 
 
 
172 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  48.17 
 
 
172 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  45.2 
 
 
176 aa  141  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  45.18 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  46.95 
 
 
172 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  44.64 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  44.31 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  45.88 
 
 
168 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  45.51 
 
 
194 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  42.07 
 
 
164 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  42.33 
 
 
164 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  42.6 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  42.6 
 
 
163 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  43.11 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  42.42 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  40.61 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  42.11 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  43.11 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  41.98 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  41.98 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  42.51 
 
 
162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  41.98 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  43.27 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  43.11 
 
 
156 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  41.92 
 
 
160 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  40.72 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  41.32 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  40.72 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  42.17 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  41.36 
 
 
162 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  41.57 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  41.57 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  41.57 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  47.48 
 
 
144 aa  111  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  41.55 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  41.55 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  41.55 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  42.55 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  46.04 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  42.96 
 
 
149 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  44.3 
 
 
142 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  40.82 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  47.48 
 
 
135 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  44.59 
 
 
286 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  45.32 
 
 
147 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  39.52 
 
 
171 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  46.43 
 
 
154 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  42.66 
 
 
150 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  35.19 
 
 
174 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  42.34 
 
 
143 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  36.88 
 
 
171 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  42.96 
 
 
142 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  37.2 
 
 
169 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  40.85 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  44.2 
 
 
136 aa  99  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  40.71 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  37.67 
 
 
271 aa  98.2  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  40.14 
 
 
146 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  40.14 
 
 
146 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  42.45 
 
 
145 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  39.86 
 
 
146 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  41.73 
 
 
140 aa  97.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  41.73 
 
 
140 aa  97.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  40.67 
 
 
143 aa  97.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  43.07 
 
 
133 aa  97.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  40.14 
 
 
145 aa  97.1  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  44.68 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  37.42 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  40.71 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  38.19 
 
 
147 aa  95.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  40.85 
 
 
147 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2150  hypothetical protein  35.85 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  34.34 
 
 
575 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>