168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2226 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  100 
 
 		 575 aa  1197    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3260  purine nucleoside permease  54.87 
 
 		 356 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1232  purine nucleoside permease  44.21 
 
 		 354 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4184  purine nucleoside permease  38.7 
 
 		 356 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4530  purine nucleoside permease  33.42 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0845  CNT family concentrative nucleoside/H+ anitporter  32.71 
 
 		 358 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673784  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4629  purine nucleoside permease  35.63 
 
 		 355 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00101608  normal  0.109746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  52.41 
 
 		 171 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3369  purine nucleoside permease  33.53 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4914  purine nucleoside permease  33.33 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.78554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3010  purine nucleoside permease  33.33 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5356  purine nucleoside permease  33.33 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5237  purine nucleoside permease  31.86 
 
 		 359 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4706  purine nucleoside permease  31.86 
 
 		 359 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0697594  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0289  purine nucleoside transporter  33.13 
 
 		 359 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1496  putative purine nucleoside permease  34.72 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0798  putative purine nucleoside permease protein  32.13 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1872  Purine nucleoside permease protein  35.67 
 
 		 364 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0409  purine nucleoside permease family protein  32.19 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1619  purine nucleoside permease  35.48 
 
 		 345 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1471  putative lipoprotein  32.19 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2138  putative lipoprotein  32.19 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0822  putative lipoprotein  32.19 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1835  putative lipoprotein  32.19 
 
 		 335 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0507  purine nucleoside permease family protein  32.19 
 
 		 335 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2112  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 353 aa  170  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0816  purine nucleoside permease  33.03 
 
 		 349 aa  170  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0745  purine nucleoside permease  31.58 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.64688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0815  purine nucleoside permease  31.58 
 
 		 371 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0746  purine nucleoside permease  32.73 
 
 		 349 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119389  normal  0.778761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0799  putative purine nucleoside permease protein  32.43 
 
 		 346 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1764  putative purine nucleoside permease protein  29.76 
 
 		 344 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.319131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1550  hypothetical protein  43.11 
 
 		 174 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1321  purine nucleoside permease  31.97 
 
 		 356 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.435473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4123  purine nucleoside permease, putative  31.49 
 
 		 343 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3758  purine nucleoside permease  31.25 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3859  purine nucleoside permease  30.41 
 
 		 343 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0564  purine nucleoside permease  30.27 
 
 		 337 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31020  purine nucleoside permease  28.12 
 
 		 402 aa  137  7.000000000000001e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171142  normal  0.23144 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76929  purine nucleoside permease  27.7 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.638652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  41.32 
 
 		 166 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10683  purine nucleoside permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00810)  29.23 
 
 		 396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  37.72 
 
 		 170 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  39.51 
 
 		 172 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  38.92 
 
 		 174 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  37.42 
 
 		 172 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  37.95 
 
 		 156 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  37.42 
 
 		 172 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  36.97 
 
 		 164 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  36.53 
 
 		 167 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  35.98 
 
 		 166 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  36.81 
 
 		 160 aa  107  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  34.13 
 
 		 168 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  34.97 
 
 		 161 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  37.42 
 
 		 156 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  37.42 
 
 		 156 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  37.42 
 
 		 156 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  36.81 
 
 		 156 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  35.98 
 
 		 157 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  35.58 
 
 		 160 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  38.36 
 
 		 157 aa  103  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  38.36 
 
 		 157 aa  103  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  35.36 
 
 		 193 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  35.58 
 
 		 160 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  34.97 
 
 		 160 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  35.19 
 
 		 162 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8503  predicted protein  40.74 
 
 		 130 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140704  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49552  predicted protein  32.97 
 
 		 241 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  35.15 
 
 		 164 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  35.58 
 
 		 160 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  34.29 
 
 		 191 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  34.38 
 
 		 195 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  34.52 
 
 		 168 aa  99.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  33.13 
 
 		 171 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  34.12 
 
 		 168 aa  97.8  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  97.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  34.71 
 
 		 164 aa  96.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  34.38 
 
 		 170 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  35.09 
 
 		 173 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  34.1 
 
 		 170 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  32.72 
 
 		 158 aa  93.6  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  31.14 
 
 		 164 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  33.53 
 
 		 176 aa  93.2  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  34.12 
 
 		 172 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  30.12 
 
 		 166 aa  93.6  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  34.34 
 
 		 168 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  34.12 
 
 		 180 aa  90.5  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  32.14 
 
 		 163 aa  90.5  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  33.12 
 
 		 171 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  28.31 
 
 		 166 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  31.93 
 
 		 164 aa  87  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  31.9 
 
 		 168 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  32.12 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>