41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4184 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4184  purine nucleoside permease  100 
 
 
356 aa  711    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1232  purine nucleoside permease  45.83 
 
 
354 aa  266  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25339  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3260  purine nucleoside permease  40.79 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  38.7 
 
 
575 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0815  purine nucleoside permease  33.9 
 
 
371 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0798  putative purine nucleoside permease protein  34.16 
 
 
381 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0745  purine nucleoside permease  33.75 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.64688  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5237  purine nucleoside permease  33.93 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3369  purine nucleoside permease  34.06 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4706  purine nucleoside permease  33.93 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0697594  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3010  purine nucleoside permease  34.23 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4914  purine nucleoside permease  34.23 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.78554  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5356  purine nucleoside permease  34.23 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2112  putative lipoprotein  33.75 
 
 
353 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1496  putative purine nucleoside permease  33.82 
 
 
370 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4629  purine nucleoside permease  33.13 
 
 
355 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00101608  normal  0.109746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0289  purine nucleoside transporter  33.75 
 
 
359 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2138  putative lipoprotein  33.44 
 
 
353 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1471  putative lipoprotein  33.44 
 
 
353 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0822  putative lipoprotein  33.44 
 
 
353 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0409  purine nucleoside permease family protein  33.44 
 
 
353 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0507  purine nucleoside permease family protein  33.44 
 
 
335 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1835  putative lipoprotein  33.44 
 
 
335 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0816  purine nucleoside permease  30.64 
 
 
349 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0746  purine nucleoside permease  30.72 
 
 
349 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119389  normal  0.778761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0799  putative purine nucleoside permease protein  35.09 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0845  CNT family concentrative nucleoside/H+ anitporter  32.82 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673784  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4530  purine nucleoside permease  31.89 
 
 
357 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1619  purine nucleoside permease  32.51 
 
 
345 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3859  purine nucleoside permease  32.54 
 
 
343 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4123  purine nucleoside permease, putative  31.36 
 
 
343 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3758  purine nucleoside permease  30.89 
 
 
340 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1872  Purine nucleoside permease protein  33.75 
 
 
364 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1764  putative purine nucleoside permease protein  29.65 
 
 
344 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.319131  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31020  purine nucleoside permease  32.31 
 
 
402 aa  125  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171142  normal  0.23144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1321  purine nucleoside permease  29.87 
 
 
356 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.435473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0564  purine nucleoside permease  29.75 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76929  purine nucleoside permease  26.95 
 
 
406 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.638652 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10683  purine nucleoside permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00810)  25.97 
 
 
396 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139964  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0849  purine or other phosphorylase family 1  29.04 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2814  purine nucleoside permease  28.9 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>