125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1550 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  45.51 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  43.11 
 
 		 575 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  38.27 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  38.27 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  36.26 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  37.42 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8503  predicted protein  41.04 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  35.8 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  36.09 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  30.25 
 
 		 160 aa  98.2  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  35.22 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  34.38 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  34.34 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  31.4 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  31.33 
 
 		 167 aa  94.4  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  35.26 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  29.75 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  30 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  33.54 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  29.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  29.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  29.38 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  34.34 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  30.25 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  30.06 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  28.66 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  29.11 
 
 		 160 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  31.06 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  32.75 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  33.54 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  34.15 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  33.53 
 
 		 168 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  28.12 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  32.64 
 
 		 271 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  28.83 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  29.56 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  32.12 
 
 		 172 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  32.12 
 
 		 172 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  34.57 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  28.48 
 
 		 160 aa  84.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  33.55 
 
 		 194 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  34.78 
 
 		 191 aa  84.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  31.49 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  30.64 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  33.94 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  29.81 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  31.17 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  31.17 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0592  protein of unknown function DUF985  34.72 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49552  predicted protein  30.43 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  36.43 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  35.04 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  31.65 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  35.77 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  33.81 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  31.29 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  33.58 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0027  cupin superfamily protein  32 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  34.81 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  27.95 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  34.59 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  34.81 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  30.67 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  30.06 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4703  hypothetical protein  26.16 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  36.57 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  33.58 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  29.17 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  29.03 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  37.31 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  37.31 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  31.36 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  30.54 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  30.54 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  34.07 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  33.58 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  33.09 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  32.84 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  36.84 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  32.58 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  34.09 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  33.58 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  30.12 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  30.99 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  30.12 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  30.12 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  26.67 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0664  hypothetical protein  29.11 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  30.54 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  27.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>