125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2150 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2150  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  59.76 
 
 
169 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  43.27 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  47.59 
 
 
146 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03971  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.283111  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0364  hypothetical protein  38.12 
 
 
155 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03981  hypothetical protein  36.25 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  43.54 
 
 
157 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  38.82 
 
 
155 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  43.92 
 
 
147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  44.68 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0305  hypothetical protein  43.71 
 
 
152 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.275629  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  43.45 
 
 
271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  43.45 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  46.62 
 
 
148 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00440  hypothetical protein  38.55 
 
 
153 aa  104  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  37.1 
 
 
176 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  44.97 
 
 
148 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  42 
 
 
168 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2039  hypothetical protein  42.57 
 
 
152 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  40.91 
 
 
162 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  40.4 
 
 
168 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  40.4 
 
 
168 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  41.33 
 
 
168 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  44.44 
 
 
148 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  43.06 
 
 
149 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  39.74 
 
 
168 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  40.67 
 
 
145 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  42.28 
 
 
147 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  42.07 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  36.78 
 
 
171 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  39.74 
 
 
168 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  39.07 
 
 
195 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  40.4 
 
 
147 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  37.14 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  38.27 
 
 
150 aa  97.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  38.96 
 
 
144 aa  97.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  42.38 
 
 
142 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  35.95 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  40.38 
 
 
155 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  41.18 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  40.65 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  43.33 
 
 
154 aa  95.9  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  34.43 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  35.95 
 
 
170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  35.26 
 
 
172 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  37.75 
 
 
168 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  40.65 
 
 
144 aa  94.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  35.26 
 
 
172 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  40.54 
 
 
153 aa  94.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  41.06 
 
 
146 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1501  hypothetical protein  40.69 
 
 
133 aa  94.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0425367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  38.71 
 
 
156 aa  94.4  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  39.22 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  40.82 
 
 
148 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  35.67 
 
 
168 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  35.85 
 
 
168 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  39.75 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  39.49 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  35.47 
 
 
193 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  35.95 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  41.72 
 
 
146 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  39.61 
 
 
142 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  34.64 
 
 
168 aa  92  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  36.21 
 
 
171 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  35.22 
 
 
168 aa  91.3  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  40.65 
 
 
143 aa  91.3  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  39.46 
 
 
140 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  41.61 
 
 
140 aa  90.9  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  38.26 
 
 
154 aa  90.9  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  30.68 
 
 
166 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  41.5 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  32.9 
 
 
160 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0862  protein of unknown function DUF985  40.27 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0577579  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  39.46 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  39.47 
 
 
136 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  34.38 
 
 
160 aa  89  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  32.9 
 
 
161 aa  89  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  34.19 
 
 
162 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  40.41 
 
 
140 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  39.46 
 
 
145 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  87.8  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  35.29 
 
 
164 aa  87.8  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  39.73 
 
 
158 aa  87.8  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  34.88 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  32.08 
 
 
160 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  30.29 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  36.42 
 
 
164 aa  86.3  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  34.93 
 
 
163 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  41.43 
 
 
133 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  37.97 
 
 
166 aa  84.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  35.06 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  38.92 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  32.32 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>