126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7610 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  72.97 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  69.72 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  73.53 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  66.97 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  66.36 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  69.61 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  65.74 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  67.86 
 
 		 154 aa  143  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  62.73 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  61.82 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  61.32 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  62.39 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  63.21 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  62.96 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  63.21 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  62.86 
 
 		 144 aa  135  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  62.26 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  59.81 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  57.01 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  61.32 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  57.01 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  62.26 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  57.94 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  59.63 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  62.62 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  60 
 
 		 170 aa  120  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  55.56 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  58.16 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  57.84 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  53.47 
 
 		 174 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  52.68 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  53.21 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  50.5 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  48.54 
 
 		 271 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  49.51 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  46.3 
 
 		 176 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  48.51 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  49.04 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  47.57 
 
 		 195 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  47.57 
 
 		 146 aa  90.9  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  49.54 
 
 		 172 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  40.4 
 
 		 167 aa  89.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  50 
 
 		 180 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  46.08 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  47.12 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  44.66 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  45.83 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  48 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  45.83 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.174279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4763  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  46.32 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  49.53 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  45.83 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  46.08 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  46.08 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  46.08 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  46.46 
 
 		 156 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  46.53 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  50 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  45.83 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  43.27 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  49.04 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  45.1 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  46.23 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3278  protein of unknown function DUF985  43.4 
 
 		 149 aa  83.6  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.873622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  48.6 
 
 		 169 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04051  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  47.57 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  43 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  47.17 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  43 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  49.04 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  41.41 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  41.05 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  47.52 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  41.35 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  41.35 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  37.61 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  39.42 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  34.91 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  48.08 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  48.08 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  48.04 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  50 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  41.05 
 
 		 164 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  49.04 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  49.04 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  43.43 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  35.24 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0305  hypothetical protein  47.17 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.275629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00440  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03971  hypothetical protein  40.38 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.283111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>