127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0592 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0592  protein of unknown function DUF985  100 
 
 
160 aa  317  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  36.49 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  37.58 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  36.49 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  34.46 
 
 
176 aa  90.9  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  36.84 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  35.4 
 
 
184 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  38.98 
 
 
168 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  36.91 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  34.73 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  41.22 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  36.91 
 
 
173 aa  84.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  37.59 
 
 
157 aa  84.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  43.55 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  38.46 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  41.73 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  35.58 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1550  hypothetical protein  34.72 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  35.57 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  38.41 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  34.44 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  34.44 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  34.9 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  34.9 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  34.9 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  39.84 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  33.61 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  31.51 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  32.89 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  31.48 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  31.51 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  37.96 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  31.85 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  44.17 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  42.34 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  39.68 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  42.34 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  41.8 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  33.77 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  39.71 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  39.2 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  36.72 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  36.75 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  36.75 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  38.64 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  41.28 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  37.59 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0027  cupin superfamily protein  30.77 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03601  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.928684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  33.81 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  34.23 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  34.75 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  39.68 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  32.28 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  33.74 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  33.12 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  30.86 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  31.79 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  38.1 
 
 
271 aa  68.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  31.06 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2900  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.725365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  29.48 
 
 
575 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  37.68 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  40.37 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  35.33 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  28.33 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  30.67 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  30.2 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  36.52 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3686  hypothetical protein  37.93 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  30.88 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  30.88 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6476  protein of unknown function DUF985  39.85 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00452762  normal  0.099609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0925  hypothetical protein  33.81 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  34.78 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  28.67 
 
 
195 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  38.41 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  36.04 
 
 
143 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0945  protein of unknown function DUF985  34.03 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08145  DUF985 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11860)  44.09 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  30 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2039  hypothetical protein  34.86 
 
 
152 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  22.29 
 
 
166 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  34.65 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  30.61 
 
 
193 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  34.38 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  31.52 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4946  hypothetical protein  39.58 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0479653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4703  hypothetical protein  30.84 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01404  hypothetical protein  30.87 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.807362  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  24.81 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0664  hypothetical protein  30.08 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  38.82 
 
 
112 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4382  hypothetical protein  35 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4469  hypothetical protein  35 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.174279 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>