138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3015 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
117 aa  239  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  84.96 
 
 
228 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  45.1 
 
 
224 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
234 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
224 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  45.54 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.14 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  42.72 
 
 
213 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  41.75 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  41.75 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  50.5 
 
 
221 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  47.75 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.78 
 
 
264 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  44.23 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  43.14 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  43.14 
 
 
235 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  39.42 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  39.45 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  40.38 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  42.34 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  38.46 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  36.19 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  35.85 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  40.59 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  39.62 
 
 
259 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  37.62 
 
 
227 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  42.99 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  38.1 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  39.39 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  36.79 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  37.74 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  40.54 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  39.05 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  37.14 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  38.1 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  38.1 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  37.25 
 
 
268 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
233 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  37.14 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  37.14 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  37.14 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  38.1 
 
 
233 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  37.14 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  33.9 
 
 
233 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  38.68 
 
 
356 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  36.63 
 
 
247 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  40.37 
 
 
242 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  39.64 
 
 
261 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  42.31 
 
 
251 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  36.79 
 
 
258 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  32.67 
 
 
209 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  33.65 
 
 
223 aa  61.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  38.83 
 
 
243 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.04 
 
 
257 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  36.54 
 
 
253 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  47.22 
 
 
244 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  41.58 
 
 
260 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  35.65 
 
 
291 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  34.65 
 
 
245 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  36.94 
 
 
264 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  35.58 
 
 
255 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
266 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  38.18 
 
 
244 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  36.04 
 
 
265 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  39.42 
 
 
280 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
236 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02584  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  33.64 
 
 
218 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02549  hypothetical protein  33.64 
 
 
218 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  42.03 
 
 
249 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  28.81 
 
 
241 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2872  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  32.71 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  32 
 
 
243 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  34.34 
 
 
251 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2156  diadenosine tetraphosphatase  41.56 
 
 
281 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.699429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  36.73 
 
 
218 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  35.16 
 
 
218 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0954  Phosphoprotein phosphatase  31.78 
 
 
218 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  35.11 
 
 
231 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
246 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  34 
 
 
251 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  35.16 
 
 
218 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  34.78 
 
 
294 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  34.78 
 
 
216 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  34.78 
 
 
216 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
238 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  33.01 
 
 
250 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  31.07 
 
 
243 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2861  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  31.78 
 
 
218 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  34.78 
 
 
216 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  34.78 
 
 
216 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  34.91 
 
 
267 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0217  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
273 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.71 
 
 
248 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  36.28 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.71 
 
 
248 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
257 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  30.93 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>