213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5880 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  100 
 
 
267 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  70.78 
 
 
249 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  43.53 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  47.83 
 
 
255 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  43.72 
 
 
356 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  44.05 
 
 
236 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  44.89 
 
 
253 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  46.61 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.39 
 
 
235 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  44.39 
 
 
235 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  41.74 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.29 
 
 
257 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  42.47 
 
 
280 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  43.17 
 
 
247 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  45 
 
 
260 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  45.53 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  46.36 
 
 
255 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  42.79 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  43.58 
 
 
249 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  44.78 
 
 
243 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  48.6 
 
 
244 aa  148  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  39.65 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  44.35 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  43.69 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  36.94 
 
 
209 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  37.61 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  42.08 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  41.31 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  44.09 
 
 
215 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.55 
 
 
260 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  39.19 
 
 
264 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  41.2 
 
 
242 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  43.4 
 
 
264 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  39.73 
 
 
224 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  39.27 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  41.18 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  41.33 
 
 
224 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  44.14 
 
 
221 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  38.97 
 
 
245 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  40.36 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  35.51 
 
 
208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.07 
 
 
244 aa  128  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  36.2 
 
 
244 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  42.04 
 
 
221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  38.12 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  39.29 
 
 
208 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.77 
 
 
219 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  31.06 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  34.39 
 
 
213 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  37.44 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.59 
 
 
213 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  35.68 
 
 
228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  37.39 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  37.78 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  32.1 
 
 
236 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  34.39 
 
 
246 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
234 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
234 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
234 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  33.9 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  30.45 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.49 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  29.27 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  29.27 
 
 
238 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  29.67 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  29.67 
 
 
234 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.07 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  38.36 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  29.27 
 
 
234 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  32.03 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  31.49 
 
 
230 aa  89.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  32.59 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.87 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.87 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  35.83 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
361 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  31.06 
 
 
230 aa  85.5  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  30.69 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  29.75 
 
 
850 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  30.84 
 
 
243 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  31.49 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  30.54 
 
 
853 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  29.27 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  32.6 
 
 
226 aa  79  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  31.9 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  30.77 
 
 
847 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3720  metallophosphoesterase  30 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  30.45 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  29.56 
 
 
830 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  30.77 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  30.35 
 
 
854 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  25.53 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>