222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3546 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  52.38 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  50.63 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  42.34 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  42.44 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  40.76 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  43.38 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  43.5 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.59 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.01 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  39.01 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  41.78 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  42.92 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  39.66 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  42.73 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  40.68 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  40 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  42.47 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  39.65 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  38.64 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  41.63 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  38.6 
 
 		 247 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  41.94 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  41.41 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  41.05 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  41.52 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  42.86 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  36.09 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.69 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  38.84 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  35.16 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  38.29 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  31.96 
 
 		 209 aa  122  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  34.22 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  33.64 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  34.63 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  37.33 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  31.98 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  37.72 
 
 		 265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  32.82 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  35.11 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  34.51 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  39.57 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.26 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  34.55 
 
 		 208 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  30.13 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  36.16 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  33.77 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  34.56 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  35.78 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.95 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  36.32 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  32.9 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  33.02 
 
 		 213 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  31.38 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  31.91 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  31.38 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  31.6 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  34.67 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  31.47 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.48 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.48 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.66 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  32.74 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  32.87 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.2 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  29.02 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  29.46 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  31.65 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  27.23 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  31.14 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  31.74 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  27.88 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  30.09 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  33.9 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  27.8 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  30.8 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  30.22 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  27.93 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  25.57 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  29.13 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  27.15 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  28.85 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  26 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  28.24 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  30.09 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  28.81 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  29.46 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  39.62 
 
 		 117 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47351  predicted protein  29.67 
 
 		 359 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  28.24 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03770  Calcineurin-like phosphoesterase  29.48 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3056  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  26.45 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.342794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>