More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4812 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  51.18 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  44 
 
 
255 aa  198  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  44.66 
 
 
280 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  43.28 
 
 
253 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  39.2 
 
 
258 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.74 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  39.74 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  41.6 
 
 
236 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  43.51 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  42.21 
 
 
356 aa  168  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  40.68 
 
 
247 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  41.46 
 
 
251 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  41.77 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.98 
 
 
244 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  37.87 
 
 
244 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.03 
 
 
257 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  39.68 
 
 
261 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  39.83 
 
 
249 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  35.84 
 
 
208 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  40.08 
 
 
243 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  39.66 
 
 
243 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.1 
 
 
260 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  37.35 
 
 
260 aa  141  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  41.59 
 
 
242 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  41.52 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  42.04 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  35.22 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  41.01 
 
 
221 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  41.15 
 
 
224 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  37.61 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  40.71 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  41.18 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  38.7 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.03 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  37.78 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  35.14 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  37.02 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  38.84 
 
 
224 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  36.82 
 
 
245 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  39.17 
 
 
221 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  35.65 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  38.18 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  35.91 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  35.02 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  35.74 
 
 
251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  36.32 
 
 
265 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  39.29 
 
 
221 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  32.07 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  37.45 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 
234 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 
234 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 
234 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.65 
 
 
219 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  31.88 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  29.46 
 
 
234 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.04 
 
 
248 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.04 
 
 
248 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  29.46 
 
 
234 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
269 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  28.98 
 
 
238 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
234 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  29.88 
 
 
234 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  30.87 
 
 
227 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  30.13 
 
 
223 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
231 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  30.6 
 
 
254 aa  95.1  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.26 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  36.16 
 
 
218 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
230 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  29.87 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  31.2 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
213 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  32.89 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  33.76 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.67 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  31.44 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  29.13 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  31.44 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  30.28 
 
 
230 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  30.7 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  29.83 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  28.05 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  32.27 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  31.35 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
361 aa  72  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  25.94 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  30.7 
 
 
847 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  29.18 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  26.61 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  29.95 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  28.81 
 
 
447 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  30.19 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>