221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1555 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  29.91 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.35 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.03 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  31.03 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  31.06 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  30.19 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  29.36 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.61 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  28.85 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  30.66 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  26.87 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  24.64 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  25.82 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  28.88 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  26.11 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  25.26 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  27.14 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  28.44 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  30.04 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
356 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  26.61 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  24.64 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  30 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  28.81 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  28.81 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  25.78 
 
 
215 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  26.11 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  31.13 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  28.4 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  29.39 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  28.81 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  28.92 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  28.81 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  25.33 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  25.94 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  25.94 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.31 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  33.02 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  24.89 
 
 
267 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  32.73 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  26.44 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  25.22 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.07 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  25.32 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  28.16 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  33.82 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  24.67 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  23.56 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  27 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  28.3 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  23.33 
 
 
280 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  31.3 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  24.47 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  24.47 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  33.08 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  29.09 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  27 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  22.57 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  27.05 
 
 
233 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  23.45 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  28.81 
 
 
117 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  23.01 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  23.97 
 
 
265 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  25.53 
 
 
218 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  26.81 
 
 
229 aa  52  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  37.25 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  22.46 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  38.57 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1753  metallophosphoesterase  40 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  25 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6039  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  38.03 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.647545  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03730  serine/threonine protein phosphatase  29.81 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  23.61 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18899  predicted protein  41.43 
 
 
327 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0217  metallophosphoesterase  31.96 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1741  metallophosphoesterase  43.06 
 
 
764 aa  49.3  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  25.76 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61419  predicted protein  39.47 
 
 
327 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00456855  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>