149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3383 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  84.96 
 
 		 117 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3012  putative serinethreonine protein phosphatase  86.87 
 
 		 102 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  42.13 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  41.2 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.09 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  41.63 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  47.57 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  40.64 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  40.18 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  40.91 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  46.08 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.68 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  37.1 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.26 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  34.55 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.55 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.8 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  33.64 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  35.11 
 
 		 259 aa  111  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  33.03 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  32.72 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  33.87 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  32.26 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  33.47 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  33.18 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  36.61 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  33.73 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  32.88 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  32.77 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.43 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  34 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  34 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  33.78 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  34.39 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  36.87 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  30.99 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  33.49 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  32.51 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  31.84 
 
 		 356 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  30.37 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  30.73 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  30.36 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  33.93 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.94 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  34.04 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  31.54 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  28.43 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  32.24 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  33.16 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  34.31 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  32.56 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  30.68 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  31.28 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  28.37 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  30.7 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  28.8 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  32.89 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  32.13 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  30.69 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  31.79 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  31.91 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  30.64 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  31.79 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  30.64 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  35.78 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  29.73 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  27.6 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  34.19 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  30.37 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  31.79 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  31.21 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  30.64 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  30.64 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  31.21 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  31.35 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  28.9 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  33.55 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  26.74 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  26.74 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  25.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  30.6 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  24.28 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  31.11 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  28.32 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  28.68 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  30.52 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3987  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.47 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  26.35 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  27.45 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  30.66 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3031  serine/threonine-specific protein phosphatase 2  29.47 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  31.65 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  29.09 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0217  metallophosphoesterase  30.8 
 
 		 273 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  22.88 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  26.47 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>