178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1488 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  100 
 
 
266 aa  533  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  46.83 
 
 
268 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  48.12 
 
 
260 aa  195  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
253 aa  194  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  45.31 
 
 
255 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  46.75 
 
 
235 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.75 
 
 
235 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.35 
 
 
257 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  44.14 
 
 
251 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  44.08 
 
 
356 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  43.75 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  43.5 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  43.04 
 
 
236 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  42.17 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  41.6 
 
 
247 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  44.87 
 
 
280 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.09 
 
 
260 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.99 
 
 
264 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  37.45 
 
 
245 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  44.62 
 
 
264 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  39.83 
 
 
249 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.63 
 
 
267 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  35.2 
 
 
245 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  39.24 
 
 
243 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.09 
 
 
244 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  39.3 
 
 
208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  41.42 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  39.24 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  35.47 
 
 
244 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  40.97 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  37.8 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  39.91 
 
 
244 aa  132  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  38.59 
 
 
242 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  37.24 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  40.27 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  35.27 
 
 
208 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.33 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  42.24 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.44 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  35.82 
 
 
269 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  33.77 
 
 
253 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  36.64 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  34.25 
 
 
209 aa  108  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  35.24 
 
 
265 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  39.68 
 
 
249 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  39.42 
 
 
221 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  40 
 
 
221 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
233 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  36.73 
 
 
224 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  31.67 
 
 
291 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
233 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  35.22 
 
 
209 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
224 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  35.27 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  32.23 
 
 
223 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  31.38 
 
 
227 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  33.89 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  32.02 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  30.36 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  30.09 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  33.19 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  33.89 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  31.49 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  33.19 
 
 
234 aa  89  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  31.3 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  32.93 
 
 
234 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  33.62 
 
 
238 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  35.24 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 
238 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  30.24 
 
 
230 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.04 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.04 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  33.62 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  30.96 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3720  metallophosphoesterase  32.11 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  28.94 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  30.22 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  27.59 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  29.54 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  26.99 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  31.06 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  26.1 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  28.99 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  29.3 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  28.99 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  29.67 
 
 
847 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0475  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0816105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  28.99 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>