205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1353 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  98.77 
 
 
243 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  88.07 
 
 
261 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  55.56 
 
 
244 aa  244  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  55.97 
 
 
242 aa  238  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.75 
 
 
244 aa  221  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  43.64 
 
 
268 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  39.41 
 
 
236 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  39.74 
 
 
235 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.74 
 
 
235 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  40.43 
 
 
247 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  44.78 
 
 
267 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  40.77 
 
 
268 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  39.66 
 
 
257 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.02 
 
 
264 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  41.41 
 
 
259 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.45 
 
 
260 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  39.22 
 
 
253 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  40.68 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  39.24 
 
 
266 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  38.5 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  38.03 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  37.55 
 
 
356 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  39.33 
 
 
280 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  34.05 
 
 
208 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  34.47 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  36.6 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  33.18 
 
 
209 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.33 
 
 
257 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  37.97 
 
 
255 aa  122  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  35.78 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  37.83 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  36.05 
 
 
265 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  37.44 
 
 
224 aa  118  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  37 
 
 
234 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  38.26 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  40.77 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.21 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  40 
 
 
221 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  30.96 
 
 
209 aa  111  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  33.19 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  35.62 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  33.87 
 
 
228 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  34.33 
 
 
213 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  32.22 
 
 
245 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  35.22 
 
 
224 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  33.92 
 
 
208 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  37.44 
 
 
221 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 
234 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 
234 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.77 
 
 
213 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  32.03 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  30.68 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
269 aa  98.6  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  30.74 
 
 
234 aa  98.2  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
223 aa  98.6  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  30.65 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  30.65 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  30.28 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  32.37 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  30 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  30.8 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  30.31 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  30.65 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.29 
 
 
254 aa  92  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  32.67 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  30 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
231 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  35.96 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  25.85 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.55 
 
 
248 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.55 
 
 
248 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  30.46 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  28.68 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  28.11 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  29.32 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
244 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03730  serine/threonine protein phosphatase  28.29 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  42.34 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  31 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0165  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  27.5 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  25.69 
 
 
334 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3720  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47351  predicted protein  25.1 
 
 
359 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  24.42 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1552  Phosphoprotein phosphatase  27.24 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.811375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>