242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3532 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  60.24 
 
 
253 aa  314  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  54.35 
 
 
356 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  48.29 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  48.07 
 
 
236 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  50.64 
 
 
268 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  44.83 
 
 
251 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  46.78 
 
 
235 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.78 
 
 
235 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  46.25 
 
 
257 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  47.83 
 
 
267 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  43.03 
 
 
268 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  45.34 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  42.41 
 
 
260 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
247 aa  175  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  41.56 
 
 
244 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  40.55 
 
 
245 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  41.77 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  40.24 
 
 
245 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  40 
 
 
280 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  40.95 
 
 
264 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  37.61 
 
 
249 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  40 
 
 
259 aa  151  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  40 
 
 
255 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  42.35 
 
 
249 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  40.09 
 
 
244 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.06 
 
 
260 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.92 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  40.68 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  37.89 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  37.1 
 
 
208 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  36 
 
 
246 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  40.25 
 
 
243 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  39.37 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  39.92 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  38.84 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  41.63 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  34.25 
 
 
209 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
224 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  37.28 
 
 
242 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  38.81 
 
 
221 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  39.55 
 
 
244 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  32.26 
 
 
209 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  36.91 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  36.24 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  37.17 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  36.04 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  34.48 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.35 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  35.14 
 
 
208 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  31.28 
 
 
223 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  34.8 
 
 
218 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  33.49 
 
 
254 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  33.19 
 
 
233 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
236 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  32.6 
 
 
233 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.84 
 
 
219 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 
234 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 
234 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  32.47 
 
 
234 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  32.47 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  32.47 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  31.38 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 
234 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  30.99 
 
 
228 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  31.17 
 
 
234 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  30.54 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  30.64 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  32.75 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.65 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.65 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  30.18 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  32.22 
 
 
230 aa  89  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
243 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
230 aa  89  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  30.13 
 
 
361 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  29.33 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  28.94 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  28.94 
 
 
850 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03730  serine/threonine protein phosphatase  29.27 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  25.86 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  32.87 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  31 
 
 
221 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  33.33 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  29.41 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  27.9 
 
 
847 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  28.09 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0475  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0816105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  27.8 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
243 aa  72  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  25.82 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  24.08 
 
 
859 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  27.62 
 
 
858 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>