260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1216 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  42.68 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  36.04 
 
 		 235 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.04 
 
 		 235 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  37.61 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  34.39 
 
 		 209 aa  133  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  38.91 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.05 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  36.94 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  36.11 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  35.11 
 
 		 255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  37.44 
 
 		 280 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.12 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  35.75 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  35.85 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  36.53 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  32.88 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  34.84 
 
 		 244 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  34.82 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  35.43 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  36.16 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  36.04 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  38.05 
 
 		 224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  36.49 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  34.63 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  36.04 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  32.13 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  36.04 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  34.84 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  37.38 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  34.08 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  35.84 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.14 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  35.09 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.39 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  36.74 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.64 
 
 		 213 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  33.03 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  30.7 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.24 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.16 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  31.67 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  31.22 
 
 		 223 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  33.2 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  30.52 
 
 		 231 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  34.52 
 
 		 234 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  37 
 
 		 235 aa  95.5  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 260 aa  95.9  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  34.34 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  32.37 
 
 		 243 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  34.34 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  33.5 
 
 		 234 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  30.92 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  33.5 
 
 		 234 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  33.5 
 
 		 234 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  28.63 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  34.2 
 
 		 244 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  33.5 
 
 		 234 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  28.45 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.52 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.52 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  32.14 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  32.99 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  34.2 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  29.74 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  34.95 
 
 		 218 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  32.1 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  36.56 
 
 		 249 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  30.27 
 
 		 227 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  31.48 
 
 		 221 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  30.15 
 
 		 236 aa  85.9  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  34.05 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  30.52 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  28.37 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  31.55 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  24.88 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  32.08 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  29.28 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  29.52 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  29.81 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  28.87 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  29.35 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  34.43 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  25.71 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  28.95 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  28.44 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  31.28 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  31.72 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  26.49 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  26.79 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  27.36 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  31.72 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1327  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.46 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  23.6 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  43.21 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1577  metallophosphoesterase  32.86 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14845  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  36.54 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>