More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4702 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  56.46 
 
 		 213 aa  244  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  55.5 
 
 		 213 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  40.09 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  45.7 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  43.44 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  40 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  38.94 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  38.5 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  38.74 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  37.68 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.73 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  39.9 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  35.56 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  38.07 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  35.59 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.77 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  35.16 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  35.62 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  35.62 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  37.88 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  35.81 
 
 		 253 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  34.16 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  38.43 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  34.63 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  34.44 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  36.36 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  34.15 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  35.78 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  35 
 
 		 356 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  34.26 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  35.65 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  37.39 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  35.24 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  34.82 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.48 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.3 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  36.21 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  32.81 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  32.27 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  31.25 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  30.35 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  31.84 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.42 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  33.03 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  32.43 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  32.59 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  33.85 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  31.28 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  30.84 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  31.28 
 
 		 234 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  31.86 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  30.67 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  38.56 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  36.02 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  32.86 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.08 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.08 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  30.34 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  32.39 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  32.16 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  33.85 
 
 		 243 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  35.84 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  31.72 
 
 		 264 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  37.93 
 
 		 280 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  35.91 
 
 		 260 aa  91.7  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  33.03 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  30.45 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  29.27 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  31.8 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  31.36 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  28.03 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  32.85 
 
 		 334 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  31.4 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  33.48 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3012  putative serinethreonine protein phosphatase  45.26 
 
 		 102 aa  84  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  34.67 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  33.02 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  43.14 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  31.48 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  30.88 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  29.61 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  34.57 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  38.46 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  29.17 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  30.7 
 
 		 852 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  31.07 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  30.95 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1794  serine/threonine protein phosphatase 1  32.04 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0491233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1929  serine/threonine protein phosphatase 1  32.04 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  30.73 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  30.73 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  30.16 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>