207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4537 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  46.58 
 
 
235 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  46.58 
 
 
235 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  43.98 
 
 
268 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  42.98 
 
 
257 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  42.24 
 
 
255 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  45.8 
 
 
266 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  40.52 
 
 
236 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  44.87 
 
 
280 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
255 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  41.49 
 
 
247 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  38.59 
 
 
253 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  41.78 
 
 
356 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  44.3 
 
 
267 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  36.71 
 
 
258 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  41.07 
 
 
249 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  37.12 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  41.32 
 
 
268 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  38.87 
 
 
257 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  38.98 
 
 
260 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  38.53 
 
 
245 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  37.9 
 
 
251 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  38.7 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  35.42 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  38.08 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  40.77 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  41.2 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.93 
 
 
260 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  36.16 
 
 
291 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.19 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  38.63 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
209 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
208 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  35.24 
 
 
269 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  36.24 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  38.15 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  37.39 
 
 
253 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  38.77 
 
 
224 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  31.53 
 
 
209 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  31.8 
 
 
254 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.04 
 
 
244 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  39.52 
 
 
249 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
224 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  32.89 
 
 
234 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  37.55 
 
 
221 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
223 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  34.09 
 
 
224 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.6 
 
 
219 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
244 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.63 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.63 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  33.88 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  36.52 
 
 
221 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  35.68 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  34.27 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  32.91 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  30.74 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
234 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  34.03 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  31.15 
 
 
234 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  33.19 
 
 
250 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  31.51 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
208 aa  85.1  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  27.78 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  32.43 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  29.68 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  32.03 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  26.94 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.85 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  29.68 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  27.15 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  27.95 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  25.88 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  29 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  31.4 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  38.74 
 
 
117 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  26.29 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2911  serine/threonine-protein phosphatase 1  26.25 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000798162  hitchhiker  0.0000000000195335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3884  serine/threonine-protein phosphatase 1  26.25 
 
 
221 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0886  serine/threonine-protein phosphatase 1  26.25 
 
 
221 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  30.74 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  30.33 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  30.29 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  26.58 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  28.69 
 
 
877 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>