199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3319 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  100 
 
 
244 aa  483  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  55.79 
 
 
261 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  55.56 
 
 
243 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  55.14 
 
 
243 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  50 
 
 
244 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  52.48 
 
 
242 aa  221  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  48.6 
 
 
267 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  41.94 
 
 
259 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  39.83 
 
 
268 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  38.36 
 
 
235 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  38.36 
 
 
235 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.56 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  39.41 
 
 
268 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  41.2 
 
 
266 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.97 
 
 
264 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  37.08 
 
 
247 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  39.37 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  39.74 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  37.9 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  41.1 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  36.21 
 
 
253 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  36.57 
 
 
257 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  36.11 
 
 
249 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  37.08 
 
 
236 aa  121  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  45.25 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  37.72 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  34.09 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
253 aa  118  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  37.44 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  34.72 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  39.92 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  34.26 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  36.99 
 
 
257 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  32.57 
 
 
209 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  36.16 
 
 
213 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
234 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
234 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
234 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.39 
 
 
219 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 
234 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  32.64 
 
 
223 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.22 
 
 
213 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  32.63 
 
 
234 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  36.4 
 
 
224 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  32.77 
 
 
234 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  35.78 
 
 
215 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  32.34 
 
 
234 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  31.76 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
234 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  34.6 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  34.18 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  32.08 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  34.23 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  35.19 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  37.13 
 
 
221 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  34.72 
 
 
291 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  34.3 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
209 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  33.93 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  28.72 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.49 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  29.2 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  31.47 
 
 
269 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  34.51 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  33.48 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.95 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.95 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  28.79 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  30.84 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  25.42 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  33.49 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  32.16 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  32.84 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  30.6 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  28.71 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  31.49 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  28.79 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  30.46 
 
 
854 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  24.26 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  25.22 
 
 
230 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3720  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  24.8 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  26.5 
 
 
852 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
850 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
863 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  25 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  30.21 
 
 
847 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
857 aa  55.5  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>