255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3111 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  100 
 
 
260 aa  520  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  49.02 
 
 
268 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  48.5 
 
 
253 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  48.51 
 
 
266 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  45.73 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  47.24 
 
 
257 aa  194  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  45.42 
 
 
356 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  42.41 
 
 
255 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  42.74 
 
 
235 aa  191  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  42.74 
 
 
235 aa  191  9e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  44.74 
 
 
251 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  42.49 
 
 
236 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  44.3 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  40.68 
 
 
268 aa  169  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  44.96 
 
 
280 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.21 
 
 
267 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  41.13 
 
 
249 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  36.1 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  42.73 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  39.29 
 
 
260 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  39.29 
 
 
264 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  41.18 
 
 
245 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  38.15 
 
 
257 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  41.67 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  42.54 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  40.27 
 
 
245 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  39.67 
 
 
234 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  40.34 
 
 
224 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  42.49 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  41.36 
 
 
215 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  41.45 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  40.17 
 
 
208 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  41.88 
 
 
221 aa  138  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  37.61 
 
 
208 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  41.95 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  39.83 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  38.96 
 
 
261 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  38.7 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  38.08 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  38.7 
 
 
243 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4537  metallophosphoesterase  39.48 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000938164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  36.55 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  33.77 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  36.07 
 
 
246 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  32.88 
 
 
209 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  39.27 
 
 
213 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  36.84 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  38.07 
 
 
213 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  37.99 
 
 
242 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  36.75 
 
 
249 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  33.62 
 
 
223 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  37.78 
 
 
221 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
291 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  35.45 
 
 
228 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.91 
 
 
219 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  31.28 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  31.72 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  32.91 
 
 
218 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  30 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  30 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  31.08 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  32.23 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  30.66 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  30.37 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  30 
 
 
234 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  30.45 
 
 
234 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  32.29 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  29 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  31.47 
 
 
234 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  29.87 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0868  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
361 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
230 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  30.22 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  27.47 
 
 
229 aa  86.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
231 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  29.87 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  29.55 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.25 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.25 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1555  serine/threonine protein phosphatase, putative  29.05 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0307054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  31.33 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  32 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  30.17 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  28 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  31.63 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  26.74 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3015  putative serine/threonine protein phosphatase  41.58 
 
 
117 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  29.44 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0475  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0816105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  24.79 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  31.91 
 
 
830 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03730  serine/threonine protein phosphatase  26.97 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3720  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
229 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  24.47 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>