More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0443 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0443  metallophosphoesterase  100 
 
 
259 aa  537  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  37.57 
 
 
256 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  36.13 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  35.26 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  31.32 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.2 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.2 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
209 aa  85.9  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.22 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  29.3 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  33 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  31.05 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  33 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.2 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  31.2 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  31.76 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  33.03 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  27.87 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  31.71 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  30.59 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  29.69 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  26.97 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  33.17 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  27.43 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  30.6 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  35.98 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.08 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  26.3 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  27.35 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  27.23 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  26.72 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  29.36 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  27.23 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  26.89 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  37.23 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  26.72 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  26.47 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  27.78 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  26.67 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0860  diadenosine tetraphosphatase  32.1 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  31.5 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.91 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  31.92 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  33.82 
 
 
268 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  26.67 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  31.16 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  32.89 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  26.07 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1197  diadenosine tetraphosphatase  32.03 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  28 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  29.95 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  27.27 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  27.63 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0165  metallophosphoesterase  30 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1983  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.57 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26306  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3454  diadenosine tetraphosphatase  33.82 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  28.64 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  35.51 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0561  diadenosine tetraphosphatase  35.77 
 
 
281 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1800  metallophosphoesterase  29.56 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0695943  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1278  serine/threonine protein phosphatase 1  28.17 
 
 
216 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01809  serine/threonine-specific protein phosphatase 1  34.35 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1804  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  34.35 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01797  hypothetical protein  34.35 
 
 
218 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  30.18 
 
 
213 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0643  diadenosine tetraphosphatase  31.43 
 
 
286 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  34.31 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0168  diadenosine tetraphosphatase  35.29 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.049626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  28.3 
 
 
213 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  34.31 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1046  diadenosine tetraphosphatase  31.39 
 
 
276 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.78168  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1340  diadenosine tetraphosphatase  35.29 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00498916  hitchhiker  0.000879118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1992  serine/threonine protein phosphatase 1  28.18 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0097  diadenosine tetraphosphatase  25.95 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0099  diadenosine tetraphosphatase  25.95 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1996  serine/threonine protein phosphatase 1  27.7 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  27.6 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0093  diadenosine tetraphosphatase  25.95 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.413361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  29.54 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0092  diadenosine tetraphosphatase  25.95 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.533237 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0094  diadenosine tetraphosphatase  25.95 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2055  serine/threonine protein phosphatase 1  28.17 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.830994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1461  serine/threonine protein phosphatase 1  28.17 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.813744  normal  0.2036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0399  diadenosine tetraphosphatase  33.58 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>