41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3012 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3012  putative serinethreonine protein phosphatase  100 
 
 
102 aa  208  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3383  hypothetical protein  86.87 
 
 
228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  43.3 
 
 
213 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  44.21 
 
 
213 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  45.26 
 
 
219 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  47.56 
 
 
221 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  42.55 
 
 
224 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  45.36 
 
 
224 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  40 
 
 
247 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  45.12 
 
 
221 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  42.86 
 
 
236 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  39.74 
 
 
266 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  43.42 
 
 
267 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  38.96 
 
 
251 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.89 
 
 
235 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  41.89 
 
 
235 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  42.27 
 
 
224 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  41.24 
 
 
234 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  38.67 
 
 
253 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  40.58 
 
 
255 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  40.85 
 
 
249 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  38.67 
 
 
258 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3111  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
260 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
280 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  41.77 
 
 
356 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  44.59 
 
 
253 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  40.26 
 
 
265 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  37.66 
 
 
259 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  38.82 
 
 
269 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  32 
 
 
244 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0815  metallophosphoesterase  36.59 
 
 
242 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266593  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0011  metallophosphoesterase  37.33 
 
 
261 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.637468  hitchhiker  0.00983747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  40 
 
 
244 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1589  metallophosphoesterase  37.68 
 
 
255 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  37.68 
 
 
257 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  36.23 
 
 
268 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
245 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5378  putative serine/threonine protein phosphatase  40 
 
 
249 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  36.62 
 
 
233 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2988  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  35.21 
 
 
264 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.479268  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  36.76 
 
 
233 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>