28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0039 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  893    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.304092  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0047  peptidoglycan binding domain-containing protein  74.78 
 
 		 448 aa  673    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.52 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0214  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.4 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.87 
 
 		 456 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0088  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  58.05 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0075  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.03 
 
 		 459 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.542735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.8 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1393  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.84 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1737  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.14 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00165447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1102  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0401  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039914  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 589 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.58 
 
 		 593 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  24.58 
 
 		 593 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  22.47 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.49 
 
 		 585 aa  51.2  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  30.86 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.46 
 
 		 596 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  30.32 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  28.48 
 
 		 453 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  27.22 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  26.4 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  27.27 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  31.77 
 
 		 504 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00877  protease  28.81 
 
 		 355 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004515  outer membrane stress sensor protease DegS  29.38 
 
 		 354 aa  43.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>