24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0088 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0088  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 448 aa  892    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  66.16 
 
 		 460 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0214  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.35 
 
 		 454 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  64.07 
 
 		 456 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0047  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.73 
 
 		 448 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0075  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.22 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.542735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0039  hypothetical protein  55.92 
 
 		 447 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.304092  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1393  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.48 
 
 		 500 aa  136  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.98 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1737  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.16 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00165447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0401  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.28 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039914  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1102  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.46 
 
 		 589 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 		 593 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  24.65 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.51 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  23.16 
 
 		 576 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3905  hypothetical protein  29.77 
 
 		 157 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306365  normal  0.736098 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.46 
 
 		 596 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  22.8 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.45 
 
 		 487 aa  47  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  26.83 
 
 		 503 aa  43.5  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>