22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0047 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0039  hypothetical protein  74.78 
 
 		 447 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.304092  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0047  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  895    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.82 
 
 		 460 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  63.18 
 
 		 456 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0214  peptidoglycan binding domain-containing protein  62.14 
 
 		 454 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0075  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.92 
 
 		 459 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.542735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0088  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  59.07 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.74 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1393  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.22 
 
 		 500 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1737  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.59 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00165447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1102  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0401  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.15 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039914  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 589 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.9 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  22.9 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.82 
 
 		 585 aa  67  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  22.5 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.77 
 
 		 513 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  28.42 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  19.37 
 
 		 485 aa  43.9  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>