More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1450 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  66.67 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  65.42 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  61.54 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  61.54 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  63 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  63.54 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  60 
 
 		 131 aa  123  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  60 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  59.05 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  59.05 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  61 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  56.73 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  56.73 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  59.26 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  59.26 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  56.7 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  55.67 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  55.77 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  55.77 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  55.77 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  59.79 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  58.16 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  58.33 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  58.16 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  56.7 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  64.58 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  58.33 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  54.81 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  58.76 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  61.54 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  60.42 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  49.51 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  38.78 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0345  30S ribosomal protein S11  38.46 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000250973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0790  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000111637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  38.46 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  35.58 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  36.73 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  36.73 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  36.73 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  36.54 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  35.71 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  34.62 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  34.62 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  38.75 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  36.73 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  35.71 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0778  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04498  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  34.62 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  36.73 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  57  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  35.58 
 
 		 129 aa  57  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  37.5 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>