More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2223 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  100 
 
 		 132 aa  266  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  90.76 
 
 		 131 aa  224  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  92.24 
 
 		 129 aa  216  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  84.43 
 
 		 131 aa  216  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  81.97 
 
 		 131 aa  209  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  78.4 
 
 		 129 aa  205  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  79.17 
 
 		 126 aa  196  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  76.03 
 
 		 126 aa  191  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  68.55 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  67.74 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  68.8 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  67.77 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  67.21 
 
 		 124 aa  174  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  66.95 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  66.95 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  66.95 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  64.06 
 
 		 129 aa  170  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  65.25 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  66.4 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  62.99 
 
 		 141 aa  155  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  62.99 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  62.61 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  62.99 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  64.29 
 
 		 136 aa  153  9e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  61.61 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  60.83 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  61.98 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  62.2 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  64.66 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  65.18 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  63.72 
 
 		 156 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  57.85 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  60.82 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  50 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  49.17 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  96.7  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  48.33 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2146  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  45 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  42.86 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  42.5 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0352  ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0522  ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.15493  unclonable  0.0000000000163363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  46.67 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>