More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0790 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0790  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 126 aa  260  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000111637  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0512  30S ribosomal protein S11  65.87 
 
 		 130 aa  192  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  60.66 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  60.66 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  60.98 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 129 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  61.48 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  157  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  61.48 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  61.48 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  57.72 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  57.85 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 129 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  58.68 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0254  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4147  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000204375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0222  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000441654  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  55.2 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0219  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3736  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000151104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4033  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372672  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0222  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000236746  unclonable  0.0000000000190612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0217  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0222  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251222  unclonable  0.0000000000422157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  55.2 
 
 		 129 aa  153  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  56.8 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  54.33 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  55.37 
 
 		 134 aa  153  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  63.39 
 
 		 131 aa  153  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  57.85 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  57.02 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  54.76 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  54.4 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  54.4 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  54.4 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  56.56 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  54.4 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  54.4 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  55.12 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  61.74 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  54.4 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  57.76 
 
 		 132 aa  151  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  59.82 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>