More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29967 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  83.87 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  82.54 
 
 		 145 aa  217  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  83.74 
 
 		 136 aa  214  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  81.1 
 
 		 150 aa  206  9e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  60.48 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  59.02 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  59.17 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  61.21 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  60.33 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  59.5 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  56.91 
 
 		 126 aa  153  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  60.34 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  59.29 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  59.29 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  59.29 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  57.02 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  60.71 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  57.02 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  57.76 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  58.62 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  56.14 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  53.33 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  52.63 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  60.87 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  54.33 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  54.33 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  54.33 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  53.54 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  54.78 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  54.78 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  56.7 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  55.65 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  39.84 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  41.67 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  39.02 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  39.02 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  38.21 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  38.52 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  39.84 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  41.18 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  38.52 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  37.7 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  34.78 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  38.66 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  36.97 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  36.89 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  39.02 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0352  ribosomal protein S11  36.97 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0522  ribosomal protein S11  36.97 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.15493  unclonable  0.0000000000163363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  39.34 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  38.21 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  37.82 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  37.7 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  40.83 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  38.21 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  38.66 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  38.66 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  38.21 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  38.66 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>