More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1645 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  100 
 
 		 132 aa  259  6e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  82.44 
 
 		 135 aa  207  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  85.04 
 
 		 138 aa  207  4e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  85.04 
 
 		 139 aa  206  6e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  84.25 
 
 		 141 aa  206  9e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  67.2 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  71.07 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  62.9 
 
 		 129 aa  156  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  65.25 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  62.5 
 
 		 126 aa  153  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  60.83 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  64.41 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  63.56 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  59.84 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  59.5 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  59.84 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  62.07 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  62.07 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  62.07 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  61.21 
 
 		 124 aa  150  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  60.8 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  56.8 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  57.03 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  61.74 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  60 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  60 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  67.83 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  59.82 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  66.94 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  58.04 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  54.78 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  61.61 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  60.42 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 132 aa  95.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  41.73 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  40.16 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  42.52 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  39.52 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  45.38 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0345  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000250973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  43.55 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04498  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0778  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0579728 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  42.74 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  39.52 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  39.52 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  41.94 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  41.94 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  43.2 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  41.18 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>