More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1245 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  100 
 
 
131 aa  265  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  82.93 
 
 
131 aa  215  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  87.18 
 
 
129 aa  215  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  81.3 
 
 
131 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  81.97 
 
 
132 aa  209  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  73.6 
 
 
129 aa  201  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  75.81 
 
 
126 aa  192  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  76.67 
 
 
126 aa  192  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  67.19 
 
 
129 aa  184  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  67.19 
 
 
129 aa  184  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  66.39 
 
 
129 aa  175  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  65.62 
 
 
129 aa  175  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  63.93 
 
 
128 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  64.71 
 
 
124 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  64.71 
 
 
124 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  64.71 
 
 
124 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  63.41 
 
 
124 aa  167  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  64.91 
 
 
124 aa  166  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  63.2 
 
 
128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  59.66 
 
 
145 aa  153  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  62.5 
 
 
149 aa  149  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  60.71 
 
 
139 aa  149  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  58.12 
 
 
136 aa  147  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  60 
 
 
141 aa  147  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  60 
 
 
139 aa  146  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  60 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  64.04 
 
 
132 aa  145  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  59.2 
 
 
138 aa  142  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  60.5 
 
 
150 aa  135  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  59.65 
 
 
132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  60.18 
 
 
156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  60.53 
 
 
132 aa  121  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  60.42 
 
 
108 aa  120  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  44.54 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
129 aa  93.6  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  46.67 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  90.5  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  45 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  43.7 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  45 
 
 
134 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 
130 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
130 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  45 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  44.17 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  45 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  45 
 
 
134 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  45 
 
 
134 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2146  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  41.18 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  45 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  39.5 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>