More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2522 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  87.2 
 
 		 129 aa  227  4e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  78.74 
 
 		 129 aa  213  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  76.38 
 
 		 129 aa  210  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  81.15 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  72.5 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  70.09 
 
 		 126 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  68.64 
 
 		 126 aa  177  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  66.67 
 
 		 132 aa  175  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  66.13 
 
 		 131 aa  174  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  63.93 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  63.93 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  69.3 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  62.71 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  62.71 
 
 		 124 aa  163  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  61.86 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  61.86 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  61.86 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  61.86 
 
 		 128 aa  156  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  58.97 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  59.84 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  60.5 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  60.5 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  55.75 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  60.68 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  52.21 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  61.74 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  52.21 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  51.33 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  55.65 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  57.26 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  53.98 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  57.73 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  43.1 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  46.55 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  42.24 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  42.24 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  42.24 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  44.44 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  44.44 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  45.69 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0345  30S ribosomal protein S11  45.22 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000250973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  43.97 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  44.83 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>