More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1620 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1620  30S ribosomal protein S11P  100 
 
 		 129 aa  259  8.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.677477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0076  30S ribosomal protein S11P  80.8 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0038  30S ribosomal protein S11P  80 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1802  30S ribosomal protein S11P  78.45 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2900  30S ribosomal protein S11P  76.42 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2223  30S ribosomal protein S11P  77.78 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2591  30S ribosomal protein S11P  76.92 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.50824  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1245  30S ribosomal protein S11P  72.65 
 
 		 131 aa  187  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000186566  normal  0.971043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2552  ribosomal protein S11P  70.49 
 
 		 129 aa  183  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1818  30S ribosomal protein S11P  72.36 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2522  30S ribosomal protein S11P  72.5 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132893  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0422  ribosomal protein S11P  68.85 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1099  30S ribosomal protein S11P  68.8 
 
 		 124 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1352  30S ribosomal protein S11P  68.6 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0272  30S ribosomal protein S11P  68.6 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0566  30S ribosomal protein S11P  68.6 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.549434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2386  30S ribosomal protein S11P  70.94 
 
 		 131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0421655  normal  0.64544 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0632  30S ribosomal protein S11P  67.77 
 
 		 124 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1398  ribosomal protein S11P  69.6 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.708751  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1813  30S ribosomal protein S11P  66.4 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0540  30S ribosomal protein S11P  66.4 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0132624 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1623  30S ribosomal protein S11P  66.4 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1654  30S ribosomal protein S11P  65.6 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29967  Ribosomal protein S14, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  60.18 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51773  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87510  40S ribosomal protein S14-B (RP59B)  61.06 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464079  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50886  predicted protein  59.48 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1053  ribosomal protein S11P  68.42 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0618466  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05960  40S ribosomal protein S14 (Broad)  59.29 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1645  30S ribosomal protein S11P  67.86 
 
 		 132 aa  141  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0100802 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00670  structural constituent of ribosome, putative  61.21 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.39165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1450  30S ribosomal protein S11  64.95 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0257  30S ribosomal protein S11P  61.21 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2146  30S ribosomal protein S11P  63.16 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000001001  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0345  30S ribosomal protein S11  40.34 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000250973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  42.37 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  42.37 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  42.37 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  42.37 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  42.37 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  42.37 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  40.68 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 135 aa  87.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  42.86 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  42.5 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  42.5 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2146  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  40.83 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  42.02 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  38.14 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  40.68 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  39.67 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  41.53 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  38.98 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  39.83 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>