More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4124 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4124  TrkA-N domain protein  100 
 
 
600 aa  1176    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0189  sodium/hydrogen exchanger  45.22 
 
 
572 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.242884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0190  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 
562 aa  375  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0192  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
552 aa  263  6e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.870085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
775 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
771 aa  131  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.24 
 
 
697 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 
773 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 
674 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  26.46 
 
 
666 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
565 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
571 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  26.39 
 
 
672 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  25.46 
 
 
762 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 
665 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 
665 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
665 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.48 
 
 
682 aa  114  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 
656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  21.92 
 
 
566 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  22.1 
 
 
566 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  25 
 
 
662 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  25.62 
 
 
665 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 
666 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 
664 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 
658 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  21.81 
 
 
566 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  24.84 
 
 
668 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  23.74 
 
 
567 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  23.92 
 
 
649 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  25.13 
 
 
564 aa  103  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.02 
 
 
567 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  25.31 
 
 
558 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  23.47 
 
 
567 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  24.34 
 
 
548 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 
693 aa  101  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 
741 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.65 
 
 
663 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 
585 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  24.84 
 
 
577 aa  99.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  24.8 
 
 
650 aa  99.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  24.96 
 
 
574 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 
666 aa  98.6  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
674 aa  97.8  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.78 
 
 
669 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  26.78 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  26.53 
 
 
663 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.78 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.78 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.78 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  26.78 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 
676 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 
668 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  28.88 
 
 
564 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
667 aa  95.5  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  24.54 
 
 
592 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
551 aa  95.5  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  26.04 
 
 
663 aa  94.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  24.81 
 
 
562 aa  94.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 
586 aa  95.1  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  27.3 
 
 
569 aa  94  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.39 
 
 
654 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  26.14 
 
 
666 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 
567 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  23.77 
 
 
563 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  23.29 
 
 
636 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 
659 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.33 
 
 
579 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.89 
 
 
670 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  22.54 
 
 
561 aa  91.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 
667 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  24.17 
 
 
558 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  25.4 
 
 
667 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  25.13 
 
 
558 aa  90.5  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.17 
 
 
558 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  24.17 
 
 
558 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  24.17 
 
 
558 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  24.17 
 
 
558 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.49 
 
 
671 aa  90.1  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  24 
 
 
558 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  24.34 
 
 
584 aa  89.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  24 
 
 
558 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  23.92 
 
 
558 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 
562 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 
654 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  23.12 
 
 
583 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  22.54 
 
 
561 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 
666 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  22.18 
 
 
562 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.53 
 
 
720 aa  89  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  23.46 
 
 
575 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.04 
 
 
588 aa  87.8  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  25.49 
 
 
568 aa  87.8  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  23.83 
 
 
558 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 
565 aa  87.4  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
598 aa  87.4  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  23.87 
 
 
558 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  23.87 
 
 
558 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  23.87 
 
 
558 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  23.87 
 
 
558 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>