More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0212 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0212  co-chaperone GrpE  100 
 
 
187 aa  373  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  42.25 
 
 
204 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  41.55 
 
 
199 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  38.13 
 
 
228 aa  101  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 
194 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.7 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  36.11 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  40.28 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  39.55 
 
 
204 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 
230 aa  97.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 
230 aa  97.8  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.41 
 
 
190 aa  97.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  37.04 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  40.31 
 
 
211 aa  96.3  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  43.65 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
188 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.06 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 
222 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  38.3 
 
 
181 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.16 
 
 
201 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 
195 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.71 
 
 
210 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  35.53 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  41.27 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.13 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 
206 aa  92.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  37.31 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  36.67 
 
 
201 aa  92  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  34.72 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 
204 aa  90.9  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
206 aa  90.9  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 
206 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  36.36 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  40.48 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.37 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  35.77 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.43 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  37.23 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  35.04 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 
195 aa  89  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  31.36 
 
 
209 aa  88.6  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  32.57 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  37.3 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 
210 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.29 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
195 aa  87  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  33.79 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  35.07 
 
 
209 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
200 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  34.56 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  34.06 
 
 
221 aa  85.9  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1473  GrpE protein  37.98 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00324826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  35.46 
 
 
260 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  37.01 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  37.8 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  42.64 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3963  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2499  heat shock protein GrpE  41.73 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0266  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  37.31 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  36.08 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0750  heat shock protein GrpE  42.42 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.84 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.61 
 
 
208 aa  84.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  32.64 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  32.86 
 
 
226 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  36.73 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  34.92 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  34.92 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  35.2 
 
 
208 aa  84.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  34.92 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  40 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  31.03 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  34.92 
 
 
241 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>