More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0823 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0823  GTP-binding protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0300  GTP-binding protein  47.28 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1907  GTP-binding protein  47.28 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1384  GTP-binding protein  42.11 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304581  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1378  GTP-binding protein  45.41 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0303  GTP-binding protein  41.58 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0535  GTP-binding protein  41.58 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.981766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0600  GTP-binding protein  44.51 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.358533  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1102  GTP-binding protein  41.71 
 
 		 205 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0625  GTP-binding protein  40.43 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.222196  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3560  small GTP-binding protein  40 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1574  small GTP-binding protein  40 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0012  GTP-binding protein  43.37 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1494  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.71 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0384  small GTP-binding protein  27.93 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.733016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  32.11 
 
 		 298 aa  61.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0361  small GTP-binding protein  30.99 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10280  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000284353  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0406  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.21 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1096  GTP-binding protein HSR1-related  27.75 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000626094  hitchhiker  0.0000000000000161313 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13390  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  27.66 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0951  small GTP-binding protein  30.61 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2142  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.05 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  30.6 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  30.6 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  30.6 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  30.6 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1093  GTP-binding protein Era  32.39 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.605646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  30.6 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  30.6 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  30.6 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0654  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.88 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000108804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  29.31 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 314 aa  54.7  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  27.81 
 
 		 311 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  27.81 
 
 		 311 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1105  GTP-binding protein HSR1-related  30.86 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.322379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4259  small GTP-binding protein  32.56 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  28.32 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2197  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.5 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  27.32 
 
 		 712 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  27.96 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  30.05 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  29.61 
 
 		 300 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  27.11 
 
 		 645 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0361  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  53.33 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0360198  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  30.21 
 
 		 666 aa  52  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 663 aa  52  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2629  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.17 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  30.82 
 
 		 688 aa  51.6  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  26.98 
 
 		 299 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2483  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.23 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.528344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  27.84 
 
 		 299 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  44.44 
 
 		 607 aa  51.2  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2350  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.17 
 
 		 256 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.268775 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.79 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000846962  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  38.14 
 
 		 659 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  31.4 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  26.16 
 
 		 645 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  27.66 
 
 		 303 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  38.14 
 
 		 666 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5082  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.45 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224728  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  29.48 
 
 		 753 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.08 
 
 		 614 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0898  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.25 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  26.84 
 
 		 298 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0407  GTP-binding protein Era  28.64 
 
 		 311 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  30.06 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  29.57 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3502  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  50 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00655951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5378  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  46.55 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2307  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  50 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.0659986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2032  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  49.15 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0524569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0842  GTP-binding protein Era  27.65 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0615921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  36.56 
 
 		 716 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  26.7 
 
 		 320 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  29.03 
 
 		 774 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  29.03 
 
 		 311 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 		 778 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  27.87 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.64 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0554  small GTP-binding protein  33.12 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  25.73 
 
 		 299 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  28.95 
 
 		 312 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 300 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0353  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.3 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0844949  normal  0.0598906 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  30.61 
 
 		 776 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1203  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.75 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0189636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  27.06 
 
 		 299 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  29.31 
 
 		 778 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0245  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.71 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000051605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  31.07 
 
 		 303 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  28.42 
 
 		 298 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  41.1 
 
 		 616 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  27.17 
 
 		 294 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1817  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  38.37 
 
 		 650 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0247  GTPase  29.37 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0652935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>