More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3560 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3560  small GTP-binding protein  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1574  small GTP-binding protein  89.27 
 
 
205 aa  390  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1102  GTP-binding protein  80 
 
 
205 aa  348  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0625  GTP-binding protein  76.59 
 
 
205 aa  338  4e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.222196  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1378  GTP-binding protein  71.08 
 
 
206 aa  311  3.9999999999999997e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1907  GTP-binding protein  48.98 
 
 
209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0300  GTP-binding protein  46.19 
 
 
207 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0823  GTP-binding protein  40 
 
 
190 aa  159  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0600  GTP-binding protein  37.44 
 
 
230 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.358533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1384  GTP-binding protein  37.44 
 
 
227 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304581  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0535  GTP-binding protein  37.44 
 
 
227 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.981766  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0303  GTP-binding protein  36.41 
 
 
227 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0012  GTP-binding protein  40.3 
 
 
227 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.41 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0898  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.57 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1237  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.78 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0772533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1105  GTP-binding protein HSR1-related  31.01 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.322379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1494  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  36.5 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0414  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.04 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1950  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.14 
 
 
218 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000597271  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1731  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.87 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.114036  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1817  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.89 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1800  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.57 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1765  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.87 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0262  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.65 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1359  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.69 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.162562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.52 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.54 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220989  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0617  hypothetical protein  28.11 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2483  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.94 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.528344  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0384  small GTP-binding protein  28.21 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.733016  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.28 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000846962  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1423  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.5 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.192754  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.65 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0553  GTP-binding protein  31.94 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332717  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0361  small GTP-binding protein  35.51 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0245  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.71 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000051605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2558  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.33 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0654  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.06 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000108804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3815  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.88 
 
 
214 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.990986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4189  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.38 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0267614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2497  small GTP-binding protein  34.06 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2391  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.66 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3013  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.48 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3899  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.88 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00203743 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0626  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.58 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0532525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2197  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.04 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13390  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  32.91 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29397  predicted protein  31.88 
 
 
253 aa  62  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000110123  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0595  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.61 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.232511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1596  small GTP-binding protein  31.54 
 
 
203 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl357  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.5 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  34.56 
 
 
453 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2171  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.69 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2032  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.51 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0524569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0951  small GTP-binding protein  32.19 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0247  GTPase  32.61 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0652935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  30.81 
 
 
456 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0246  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.87 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0886847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1311  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.14 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0010673  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04531  GTP-binding protein EngA  28.81 
 
 
458 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.491515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2584  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.58 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 
471 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1520  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.28 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  29.19 
 
 
500 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1361  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.86 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10280  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  27.84 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000284353  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.85 
 
 
254 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1203  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.37 
 
 
201 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0189636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2263  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  34.51 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf693  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.67 
 
 
183 aa  58.9  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  34.07 
 
 
465 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  30.81 
 
 
734 aa  58.9  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0443  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.68 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.793464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0868  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32.85 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1652  GTP-binding protein  30.41 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1273  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.66 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  36.3 
 
 
458 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  30.81 
 
 
314 aa  58.2  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  29.85 
 
 
315 aa  58.2  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0935  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.05 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0346  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.48 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0636282 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  26.74 
 
 
778 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
465 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0634  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.19 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
465 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 
783 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4101  cell division checkpoint GTPase YihA  31.69 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000815847  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3570  GTP-binding protein, HSR1-related  31.25 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.777436  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05518  GTP binding protein (EngB), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13010)  28.29 
 
 
332 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0212  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.77 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  31.85 
 
 
439 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1096  GTP-binding protein HSR1-related  30.61 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000626094  hitchhiker  0.0000000000000161313 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  32.37 
 
 
457 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  29.94 
 
 
452 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0321  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.77 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3966  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  31.13 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000926222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0188  cell division checkpoint GTPase YihA  27.11 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0384497  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2742  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.22 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.313609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0667  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.33 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>