More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0247 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0247  GTPase  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0652935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1520  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  63.35 
 
 
194 aa  265  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0654  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  62.3 
 
 
196 aa  251  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000108804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1273  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  60.75 
 
 
195 aa  240  7.999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.256422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0626  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  56.45 
 
 
199 aa  226  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0532525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1237  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  57.46 
 
 
195 aa  223  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0772533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1311  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  55.91 
 
 
198 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0010673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1765  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  54.01 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1731  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  54.01 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.114036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  51.81 
 
 
194 aa  218  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000846962  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2584  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  51.34 
 
 
193 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3183  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4560  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  201  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4366  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4202  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.387044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4213  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4701  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4556  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4605  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.95 
 
 
198 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4587  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  47.89 
 
 
198 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.872374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0647  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  47.89 
 
 
198 aa  197  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0868  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  48.66 
 
 
195 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4314  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  47.89 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14900  GTP-binding protein HSR1-related  45.79 
 
 
199 aa  191  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.527689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2558  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  52.81 
 
 
205 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1643  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  47.37 
 
 
197 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00260781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1381  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  47.37 
 
 
197 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.479238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0465  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.84 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0596  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  46.56 
 
 
207 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.502995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1652  GTP-binding protein  49.43 
 
 
219 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3013  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.23 
 
 
206 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1117  GTP-binding protein HSR1-related  46.7 
 
 
197 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1105  GTP-binding protein HSR1-related  45.55 
 
 
193 aa  171  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.322379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4052  GTP-binding protein, HSR1-related  45.6 
 
 
198 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  45.16 
 
 
192 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4189  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.27 
 
 
204 aa  168  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0267614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3352  small GTP-binding protein  43.23 
 
 
201 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0529081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  46.24 
 
 
201 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2497  small GTP-binding protein  41.36 
 
 
198 aa  165  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3899  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.59 
 
 
214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00203743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0456  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.44 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0898  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.09 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3815  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.63 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.990986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0380  GTP-binding protein HSR1-related  46.82 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000322823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1841  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.71 
 
 
220 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3276  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.25 
 
 
200 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2032  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.39 
 
 
192 aa  158  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0524569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5592  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.24 
 
 
198 aa  158  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352235  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl357  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.39 
 
 
198 aa  155  4e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000515524  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0377  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  46.11 
 
 
195 aa  154  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.247642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2302  GTP-binding protein HSR1-related protein  42.35 
 
 
204 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000228777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2742  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.18 
 
 
207 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.313609  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0245  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.51 
 
 
196 aa  152  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000051605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0935  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.72 
 
 
204 aa  151  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6291  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.94 
 
 
215 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5104  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.48 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0139  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2263  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.4 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0124  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  39.52 
 
 
210 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10118  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3570  GTP-binding protein, HSR1-related  38.5 
 
 
214 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.777436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0141  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  39.52 
 
 
210 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2672  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.99 
 
 
216 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922288  normal  0.0302457 
 
 
-
 
NC_002950  PG0346  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  39.79 
 
 
201 aa  143  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0636282 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  43.12 
 
 
197 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0275  GTP-binding protein HSR1-related protein  41.67 
 
 
191 aa  144  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72480  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.82 
 
 
215 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0976  GTP-binding protein HSR1-related  44.17 
 
 
201 aa  143  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2681  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.67 
 
 
216 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.768728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0088  cell division checkpoint GTPase YihA  39.11 
 
 
209 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0343  GTP-binding protein EngB  40.48 
 
 
211 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02010  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  42.78 
 
 
216 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.646558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2867  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.12 
 
 
216 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2774  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.12 
 
 
216 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7093  small GTP-binding protein  41.24 
 
 
202 aa  141  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000783147  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0212  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  39.78 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0232  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.99 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2857  cell division checkpoint GTPase YihA  38.55 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.956898  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0055  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.656456  normal  0.831719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1800  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.02 
 
 
210 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3669  small GTP-binding protein  45.45 
 
 
218 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0269  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40 
 
 
235 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0414  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  46.21 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1531  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.25 
 
 
219 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.348645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2604  GTP-binding protein  38.07 
 
 
210 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1817  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.22 
 
 
194 aa  137  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0155  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  41.57 
 
 
216 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0075  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.34 
 
 
213 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.611399  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0047  GTP-binding protein, HSR1-related  37.5 
 
 
212 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165704  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1096  GTP-binding protein HSR1-related  42.29 
 
 
193 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000626094  hitchhiker  0.0000000000000161313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3117  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.95 
 
 
207 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0361  small GTP-binding protein  40.57 
 
 
194 aa  135  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.02 
 
 
205 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0139  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.5 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0124  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  37.5 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2391  GTP-binding protein, HSR1-related  42.33 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4065  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  36.98 
 
 
201 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0625  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.7 
 
 
220 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1359  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  46.26 
 
 
195 aa  132  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.162562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06570  GTP-binding protein  37.11 
 
 
202 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0617  hypothetical protein  39.58 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>