231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0300 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0300  GTP-binding protein  100 
 
 
207 aa  413  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1907  GTP-binding protein  66.16 
 
 
209 aa  281  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1378  GTP-binding protein  48.22 
 
 
206 aa  202  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1574  small GTP-binding protein  48.73 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1102  GTP-binding protein  46.7 
 
 
205 aa  199  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3560  small GTP-binding protein  46.19 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0823  GTP-binding protein  47.28 
 
 
190 aa  193  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0625  GTP-binding protein  45.18 
 
 
205 aa  193  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.222196  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0535  GTP-binding protein  44.74 
 
 
227 aa  177  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.981766  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1384  GTP-binding protein  44.74 
 
 
227 aa  177  9e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304581  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0303  GTP-binding protein  44.21 
 
 
227 aa  174  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0600  GTP-binding protein  43.03 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.358533  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0012  GTP-binding protein  48.89 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0262  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.62 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0384  small GTP-binding protein  27.09 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.733016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0361  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.92 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0360198  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1381  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.07 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.479238  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10280  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  28.35 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000284353  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1643  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.34 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00260781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1817  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.48 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1494  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.82 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2483  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.87 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.528344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0898  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.1 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2742  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.57 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.313609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4560  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.38 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4366  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.38 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4202  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.38 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.387044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4213  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.38 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0443  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.9 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.793464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4701  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.38 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4556  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.38 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4605  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.38 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf693  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.53 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.86 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000846962  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3329  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23.62 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.330314  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0595  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  32 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.232511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0406  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.2 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4587  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.51 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.872374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1105  GTP-binding protein HSR1-related  28.28 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.322379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0414  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.16 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29397  predicted protein  25.37 
 
 
253 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000110123  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0647  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.51 
 
 
198 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0361  small GTP-binding protein  27.27 
 
 
194 aa  52  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4314  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.9 
 
 
198 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.7 
 
 
195 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3702  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.57 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3073  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23.23 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.574701  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0212  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.33 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1950  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.36 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000597271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3952  GTP-binding protein HSR1-related  27.88 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0353  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  39.74 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0844949  normal  0.0598906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0326  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.32 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2142  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.09 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1429  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 
697 aa  49.7  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2391  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.41 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1359  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.29 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.162562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5378  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.05 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4259  small GTP-binding protein  28.72 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0457  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.09 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.934931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1361  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  44.62 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3502  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24 
 
 
217 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0374  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.7 
 
 
254 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0899895 
 
 
-
 
NC_002950  PG0346  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.24 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0636282 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0667  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  40.21 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3183  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.47 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5082  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.06 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224728  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  24.71 
 
 
634 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0976  GTP-binding protein HSR1-related  26.14 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  26.92 
 
 
824 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0275  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.42 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  23.35 
 
 
769 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3340  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  38.24 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0579  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.25 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.161528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2307  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.16 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.0659986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0639  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.97 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  25 
 
 
770 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2672  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.3 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922288  normal  0.0302457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2629  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.83 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  0.0518679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1800  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.57 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  26.32 
 
 
298 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1202  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23.68 
 
 
226 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0025495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14900  GTP-binding protein HSR1-related  32.12 
 
 
199 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.527689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2302  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.87 
 
 
204 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000228777  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0634  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  28.18 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  44.12 
 
 
197 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2350  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.83 
 
 
256 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.268775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  50 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23.12 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.034569  normal  0.192806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0868  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23.72 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7327  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  23 
 
 
220 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1096  GTP-binding protein HSR1-related  27.96 
 
 
193 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000626094  hitchhiker  0.0000000000000161313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  50 
 
 
299 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0682  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.84 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.99149  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0321  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  33.33 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3570  GTP-binding protein, HSR1-related  28.81 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.777436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2391  GTP-binding protein, HSR1-related  26.32 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  25 
 
 
721 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2727  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.16 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0646031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0456  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  22.28 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0574752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>