More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4259 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4259  small GTP-binding protein  100 
 
 		 176 aa  343  8.999999999999999e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0554  small GTP-binding protein  86.36 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3545  small GTP-binding protein  75 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  61.88 
 
 		 776 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  65.19 
 
 		 778 aa  199  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  62.82 
 
 		 743 aa  198  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  59.88 
 
 		 770 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  58.43 
 
 		 770 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  53.37 
 
 		 720 aa  194  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  61.25 
 
 		 826 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  56.05 
 
 		 680 aa  189  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  56.55 
 
 		 786 aa  190  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  56.36 
 
 		 728 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  55.19 
 
 		 676 aa  187  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  57.33 
 
 		 631 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  56.52 
 
 		 631 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  58.67 
 
 		 743 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  56.33 
 
 		 680 aa  184  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  58 
 
 		 666 aa  184  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  58.67 
 
 		 666 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  58.82 
 
 		 657 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  58.67 
 
 		 741 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  58 
 
 		 741 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  52.2 
 
 		 783 aa  180  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  56.02 
 
 		 738 aa  180  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  51.53 
 
 		 778 aa  180  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  56.6 
 
 		 786 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  52.66 
 
 		 753 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  56.13 
 
 		 725 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  57.67 
 
 		 722 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  58.67 
 
 		 740 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  51.57 
 
 		 662 aa  178  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  54.94 
 
 		 747 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  54.94 
 
 		 749 aa  177  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  54.84 
 
 		 713 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  56.02 
 
 		 766 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  56.02 
 
 		 766 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  54.67 
 
 		 688 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  55.56 
 
 		 649 aa  175  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  58.28 
 
 		 732 aa  174  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  51.9 
 
 		 774 aa  174  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  56.49 
 
 		 725 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  51.57 
 
 		 816 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  54.3 
 
 		 665 aa  173  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  57.79 
 
 		 759 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  54.72 
 
 		 778 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  51.57 
 
 		 816 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  55.48 
 
 		 723 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0571  ferrous iron transport protein B  55.33 
 
 		 845 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  50.65 
 
 		 822 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  56.67 
 
 		 740 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  53.33 
 
 		 669 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  56.02 
 
 		 753 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3772  GTP-binding protein HSR1-related  50.31 
 
 		 271 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3838  small GTP-binding protein  50.61 
 
 		 262 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  54 
 
 		 716 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  52.67 
 
 		 669 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1538  GTP-binding protein, HSR1-related  52.8 
 
 		 259 aa  170  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  57.67 
 
 		 772 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  57.67 
 
 		 772 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  57.67 
 
 		 772 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  54.67 
 
 		 824 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1972  small GTP-binding protein  48.78 
 
 		 244 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0845382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  49.7 
 
 		 774 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  57.67 
 
 		 772 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  57.67 
 
 		 772 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  54.67 
 
 		 724 aa  168  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  58.97 
 
 		 676 aa  168  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1406  GTP-binding protein, HSR1-related  54.04 
 
 		 264 aa  168  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  53.8 
 
 		 691 aa  168  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 773 aa  167  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  53.33 
 
 		 712 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4511  small GTP-binding protein  50.93 
 
 		 276 aa  165  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154216  normal  0.99692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  52.7 
 
 		 717 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  52.17 
 
 		 725 aa  164  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2275  small GTP-binding protein  54 
 
 		 244 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  49.03 
 
 		 662 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 772 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  52.15 
 
 		 712 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  51.88 
 
 		 720 aa  163  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  50.62 
 
 		 766 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02710  Ferrous iron transport protein FeoB  49.69 
 
 		 262 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  50.62 
 
 		 782 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  53.37 
 
 		 771 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  53.37 
 
 		 771 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  53.37 
 
 		 771 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2719  GTP-binding protein, HSR1-related  48.17 
 
 		 261 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0076047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  50.67 
 
 		 715 aa  160  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0850  ferrous iron transport protein B  50.31 
 
 		 695 aa  160  9e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  50.64 
 
 		 665 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  48.54 
 
 		 713 aa  159  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  50.66 
 
 		 714 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>