More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0554 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0554  small GTP-binding protein  100 
 
 		 176 aa  349  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4259  small GTP-binding protein  86.36 
 
 		 176 aa  298  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3545  small GTP-binding protein  77.12 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  54.82 
 
 		 680 aa  191  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  54.78 
 
 		 676 aa  191  6e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  60.98 
 
 		 778 aa  188  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  59.26 
 
 		 826 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  58.6 
 
 		 743 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  57.14 
 
 		 786 aa  184  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  54.55 
 
 		 688 aa  183  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  56.33 
 
 		 680 aa  183  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  51.53 
 
 		 720 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  57.33 
 
 		 631 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  55.92 
 
 		 669 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  55.26 
 
 		 669 aa  180  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  55.92 
 
 		 665 aa  180  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  57.33 
 
 		 631 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  56.49 
 
 		 657 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  55.84 
 
 		 724 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  56.25 
 
 		 776 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  57.05 
 
 		 666 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  50.86 
 
 		 778 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  55.84 
 
 		 666 aa  174  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  58.06 
 
 		 722 aa  174  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3772  GTP-binding protein HSR1-related  51.2 
 
 		 271 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  53.7 
 
 		 770 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  51.57 
 
 		 783 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  57.33 
 
 		 749 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  53.16 
 
 		 713 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  52.12 
 
 		 728 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  53.09 
 
 		 770 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  49.7 
 
 		 753 aa  171  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  54.84 
 
 		 725 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  54.61 
 
 		 743 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  55.26 
 
 		 741 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  55.84 
 
 		 725 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  49.68 
 
 		 662 aa  168  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  49.4 
 
 		 816 aa  167  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  50.31 
 
 		 662 aa  167  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  49.4 
 
 		 816 aa  167  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  52.17 
 
 		 649 aa  167  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  57.14 
 
 		 676 aa  167  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  53.9 
 
 		 740 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  55.19 
 
 		 732 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  50.59 
 
 		 824 aa  166  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  53.95 
 
 		 741 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1538  GTP-binding protein, HSR1-related  48.55 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3838  small GTP-binding protein  50.92 
 
 		 262 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  49.39 
 
 		 725 aa  164  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2275  small GTP-binding protein  51.25 
 
 		 244 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  49.71 
 
 		 713 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0571  ferrous iron transport protein B  53.33 
 
 		 845 aa  164  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  55.13 
 
 		 759 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  49.08 
 
 		 720 aa  164  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4511  small GTP-binding protein  50.31 
 
 		 276 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154216  normal  0.99692 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  45.83 
 
 		 822 aa  164  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1972  small GTP-binding protein  47.24 
 
 		 244 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0845382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  50.62 
 
 		 665 aa  163  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1406  GTP-binding protein, HSR1-related  53.42 
 
 		 264 aa  163  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  55.13 
 
 		 753 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  50.9 
 
 		 738 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  53.61 
 
 		 766 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  52.87 
 
 		 766 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0850  ferrous iron transport protein B  53.25 
 
 		 695 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  51.92 
 
 		 747 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  52.2 
 
 		 786 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2719  GTP-binding protein, HSR1-related  49.08 
 
 		 261 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0076047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  50.32 
 
 		 774 aa  160  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  51.57 
 
 		 778 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  50.32 
 
 		 716 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  51.27 
 
 		 691 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  52.2 
 
 		 723 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  51.33 
 
 		 715 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 772 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  54.43 
 
 		 712 aa  159  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  52.63 
 
 		 740 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0601  small GTP-binding protein  47.74 
 
 		 240 aa  158  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 772 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0629  small GTP-binding protein  46.45 
 
 		 240 aa  158  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  47.83 
 
 		 766 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  47.83 
 
 		 782 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 772 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0842  ferrous iron transport protein B, N- region  46.67 
 
 		 240 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 772 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  56.44 
 
 		 772 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0679  ferrous iron transport protein B  46.67 
 
 		 240 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0623  ferrous iron transport protein B, N-terminal region  46.67 
 
 		 240 aa  157  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0768  ferrous iron transport protein B, N- region  46.67 
 
 		 240 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  47.93 
 
 		 717 aa  157  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4589  ferrous iron transport protein B  47.33 
 
 		 240 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  50.97 
 
 		 704 aa  157  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  55.21 
 
 		 773 aa  156  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  55.21 
 
 		 773 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  55.21 
 
 		 773 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  55.21 
 
 		 773 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  55.21 
 
 		 773 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  55.21 
 
 		 773 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  55.21 
 
 		 773 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  50 
 
 		 712 aa  156  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  55.21 
 
 		 773 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>