85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1764 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  65.69 
 
 
141 aa  191  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  57.25 
 
 
148 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  63.64 
 
 
145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  60.31 
 
 
133 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  60.31 
 
 
133 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  57.25 
 
 
141 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  65.52 
 
 
157 aa  167  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  63.79 
 
 
144 aa  160  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  60 
 
 
143 aa  156  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  57.14 
 
 
131 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  54.96 
 
 
145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  53.79 
 
 
146 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  51.47 
 
 
143 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  55.37 
 
 
130 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  52.52 
 
 
139 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  55.93 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  57.35 
 
 
161 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  52.71 
 
 
137 aa  140  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  53.97 
 
 
149 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  59.32 
 
 
171 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  59.05 
 
 
147 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  47.18 
 
 
143 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  48.03 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  45.11 
 
 
137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  52.71 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  48.09 
 
 
462 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  48.09 
 
 
462 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  61.02 
 
 
142 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  50.42 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  46.92 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  43.1 
 
 
148 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  43.27 
 
 
132 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  32.17 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  32.17 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  30.97 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  34.34 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  31.86 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  29.46 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  30 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  29.82 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  33.64 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  28.32 
 
 
119 aa  47  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  24.53 
 
 
121 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  39.29 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  28.18 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  28.3 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  28.45 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  31.91 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2798  arsenate reductase and related  26.04 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  25.45 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  28.95 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  27.62 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  27.03 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  29.59 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  27.88 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3279  arsenate reductase  28.12 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  26.05 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  26.67 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3135  arsenate reductase  31.25 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3181  transcriptional regulator Spx  20.17 
 
 
131 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2219  arsenate reductase  32.65 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2061  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3202  transcriptional regulator Spx  20.17 
 
 
131 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0489409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  21.01 
 
 
131 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3456  transcriptional regulator Spx  20.17 
 
 
131 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3422  transcriptional regulator Spx  20.17 
 
 
131 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3109  transcriptional regulator Spx  20.17 
 
 
131 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  29.63 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  30.97 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  34.43 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  29.52 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5135  arsenate reductase related protein  27.52 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  29.63 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2389  arsenate reductase  24 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  26.96 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  46.51 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  19.33 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  29.17 
 
 
317 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  30.19 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1785  arsenate reductase  25.26 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0225096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  27.43 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02434  arsenate reductase  25.51 
 
 
162 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.94591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1359  arsenate reductase  21.62 
 
 
133 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00176431  normal  0.0126888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  26.72 
 
 
119 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>