56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2105 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2105  nitrogenase-associated protein  100 
 
 
150 aa  316  7.999999999999999e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.980388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1650  nitrogenase-associated protein  60 
 
 
150 aa  203  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0911  nitrogenase-associated protein  56.55 
 
 
148 aa  190  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1555  nitrogenase-associated protein  52.41 
 
 
137 aa  166  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.65637  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2631  nitrogenase-associated protein  43.36 
 
 
157 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2504  nitrogenase-associated protein  45.65 
 
 
137 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3773  nitrogenase-associated protein  43.26 
 
 
144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4806  nitrogenase-associated protein  42.86 
 
 
141 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0471  nitrogenase-associated protein  44.12 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1764  nitrogenase-associated protein  48.03 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4315  nitrogenase-associated protein  49.18 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00428414  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1007  nitrogenase-associated protein  43.48 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1208  nitrogenase-associated protein  48.55 
 
 
146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0511  nitrogenase-associated protein  42.75 
 
 
149 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0223  nitrogenase-associated protein  50.86 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1186  nitrogenase-associated protein  47.46 
 
 
130 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1525  ADP-ribosyl-[dinitrogen reductase] hydrolase  49.54 
 
 
462 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1243  ADP-ribosyl-(dinitrogen reductase) hydrolase  49.54 
 
 
462 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.555691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0145  nitrogenase-associated protein  43.48 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.776739  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1054  nitrogenase-associated protein  45.76 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1192  nitrogenase-associated protein  46.55 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1840  nitrogenase-associated protein  38.67 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1800  nitrogenase-associated protein  41.01 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.663505  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0451  nitrogenase-associated protein  42.03 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1772  nitrogenase-associated protein  41.01 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0427  nitrogenase-associated protein  40.88 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5881  putative arsenate reductase (nitrogenase-associated protein)  39.01 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0819125  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51030  nitrogenase-associated protein  42.86 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0511057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1460  nitrogenase-associated protein  44.83 
 
 
161 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00556054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1452  nitrogenase-associated protein  43.97 
 
 
159 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2351  nitrogenase-associated protein  46.61 
 
 
142 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29330  hypothetical protein  40.16 
 
 
142 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1060  nitrogenase-associated protein  36.04 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0660619  hitchhiker  0.0000873052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  26.92 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0237  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.323435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  25 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2271  arsenate reductase  27.37 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  46.34 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  30.93 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  27.73 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1485  arsenate reductase  30.39 
 
 
117 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  37.78 
 
 
118 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00627  arsenate reductase  29.03 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  27.93 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  27.45 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1881  arsenate reductase  27.68 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  25.47 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  29.9 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  27.93 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5671  arsenate reductase  26.8 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229186  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4429  arsenate reductase  31.25 
 
 
134 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2504  arsenate reductase and related  25.45 
 
 
120 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>