279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3754 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  80.18 
 
 		 138 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  79.46 
 
 		 115 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  71.19 
 
 		 121 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  72.03 
 
 		 121 aa  182  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  74.11 
 
 		 115 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  73.04 
 
 		 115 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  71.17 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  72.32 
 
 		 115 aa  174  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  68.1 
 
 		 116 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  74.55 
 
 		 118 aa  173  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  74.77 
 
 		 119 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  70.91 
 
 		 116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  72.48 
 
 		 116 aa  170  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  69.37 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  69.37 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  69.37 
 
 		 115 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  69.37 
 
 		 118 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  68.47 
 
 		 115 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  67.26 
 
 		 113 aa  164  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  69.37 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  65.77 
 
 		 115 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  64.86 
 
 		 115 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  67.57 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  69.44 
 
 		 118 aa  161  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  68.18 
 
 		 119 aa  159  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  66.36 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  70 
 
 		 117 aa  149  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  62.73 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  62.73 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  55.05 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  53.1 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  53.51 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  54.63 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  50.91 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  47.75 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  53.51 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  51.33 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  54.46 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  51.33 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  51.33 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  50 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  46.36 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  51.75 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  46.36 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  52.68 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  52.68 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2038  arsenate reductase and related  50.43 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  48.62 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  52.68 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  46.36 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  51.79 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  45.45 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  46.43 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  51.79 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  45.45 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  45.45 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  48.18 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  50 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  45.45 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  54.46 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  47.22 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  50.89 
 
 		 115 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1868  hypothetical protein  51.79 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  47.22 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  50.91 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  49.55 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  50 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  44.64 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  46.73 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  49.55 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  44.44 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  42.73 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  47.32 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  42.73 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  54.13 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1360  arsenate reductase-like protein  50 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  48.21 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  45.28 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  45.37 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  46.22 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  53.21 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  47.32 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  47.32 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  47.32 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  47.32 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  47.32 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  46.22 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  51.43 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  46.43 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  46.43 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  47.32 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  47.75 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  40.71 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  48.18 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>