252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2605 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  256  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  49.54 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  51.79 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  46.36 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  44.25 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  47.37 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  45.54 
 
 		 115 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  43.75 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  45.95 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  43.64 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  42.73 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  49.09 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  40.91 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  47.75 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  43.64 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  49.09 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  44.86 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  45.05 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  44.86 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  39.64 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  45.28 
 
 		 113 aa  110  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  45.05 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  45.28 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  46.02 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  46.02 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  42.24 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  46.02 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  46.02 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  48.18 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  47.27 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  46.02 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  43.93 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  46.02 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  43.4 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  47.06 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  40 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  45.3 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  42.06 
 
 		 115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  41.82 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  44.55 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  46.79 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  40 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  40 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  46.43 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  44.25 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  44.14 
 
 		 114 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  45.05 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  45.45 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  46.79 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  46.79 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  44.55 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  42.98 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  42.98 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  39.09 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  39.09 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  44.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  42.34 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  45.45 
 
 		 152 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  46.6 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  42.73 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  40.54 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  45.45 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  41.82 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2450  ArsC family protein  39.17 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1350  arsenate reductase and related  40.68 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  42.73 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  41.12 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  43.86 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  44.55 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  41.23 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  41.23 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  42.74 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  40.19 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  41.23 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  40.57 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1567  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0559  hypothetical protein  45.45 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  44.12 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  42.11 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  40.57 
 
 		 115 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  40.57 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  42.73 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  41.07 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  40.57 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  36.36 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  41.82 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  39.64 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  38.89 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>